(gH) : quelques calculs Statistiques
gilles.hunault@univ-angers.fr
On trouvera sur cette page quelques calculs simples en statistiques que tout logiciel statistique sait exécuter rapidement... ce qui montre qu'Excel n'est pas un logiciel de statistiques même si c'est un tableur doté de fonctions statistiques... On lui préférera donc le logiciel gratuit R disponible sous Windows comme sous Unix et Mac Os.
On y trouvera aussi quelques calculs un peu plus sophistiqués utiles pour chercheurs...
Les graphiques tracés (comme par exemple ceux issus de jphistopct) utilisent jpgraph.
Certains calculs sont effectués via des bibliothèques ou des portions de code de phpmath, Math_Stats ou de pecl/stats.
Nous remercions leurs auteurs pour la disponibilité de ces codes-sources.
Calculs de valeurs diagnostiques : sensibilité, spécificité, valeurs prédictives positives et négatives, odd-ratio (rapport de cotes) etc. Tracé de Courbe ROC avec affichage de sensibilité, spécificité, valeurs prédictives positives et négatives, indice de Youden. Comparaison de deux AUROCS indépendantes. sachant leur aire et leur erreur standard. Comparaison (Delong) de deux AUROCS ou plus appariées. pour des données QT appariées à une même variable QL binaire. Index et test d'Obuchowski. pour des données QT appariées à une même variable QL de classe METAVIR. Spécificité et sensibilité pour un gold standard imparfait (sachant les paramètres du gold standard).
Diagramme tige et feuille "stem and leaf" (pour des données entières). Régression linéaire simple en anglais (recopié et adapté de ibm.com). Comparaison de pourcentages (comparaison bilatérale pour des échantillons non appariés). Comparaison de moyennes (comparaison bilatérale pour des échantillons gaussiens indépendants dont les variances sont supposées connues). Calcul de chi-deux d'indépendance (comparaison d'effectifs pour la recherche de liaison entre modalités). Tracé d'histogrammes interactifs par URL (donnez les effectifs, la machine calcule les pourcentages et les affiche). Découpage en classes, méthode GDR (GDR=Grandes différences relatives). Tracé de boites à moustaches globales et par sous-groupe (facteur). Estimations ponctuelles et intervalles de confiance pour une proportion, une moyenne ou un écart-type. Calculs de tailles d'échantillon pour estimer une proportion, une moyenne, un coefficient de corrélation classique ou intra-classes. Analyse détaillée d'une variable quantitative caractéristiques (m, s, cv, q2...), tests de normalité, graphiques, valeurs extrêmes ("outliers"). Indice de fiabilité (coefficient d'homogénéité relative) d'une variable quantitative si les données sont à valeurs dans un intervalle fixe.
Quelques formules de calcul sont dans le fichier formules.pdf au format Acrobat Reader et dans le fichier formules.ps au format Postscript ; un document lisible avec les formules en annexe nommé raps.pdf fournit les bases des études statistiques.
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