Cours CMI / M1 Données     Le but des deux premières séances est de fournir une compréhension «soutenue» de l'utilisation des commandes Linux en ligne de commandes et dans des scripts Bash, Perl ou Python pour traiter des données importantes en nombre de fichiers et en volume. La troisième séance fournira des exemples de visualisation et d'automatisation en R pour des données issues de mapping.    Séance 1  Commandes et enchainement de commandes Linux   On y révise ce qu'est le système d'exploitation Linux avec ses principales commandes, dont ls, cat, head, tail, find, wc, grep, mkdir, gzip, gunzip, rm. Les scripts Bash, Perl et Python sont présentés de façon succinte. Merci de cliquer  ici  pour accéder à cette séance.   Pour celles et ceux qui font les T.P. à distance sous Windows, vérifier que les exécutables de l'archive outilsXMLpourWindows fournissent les mêmes outils pour Windows dans une session de terminal ouverte via cmd.    Séance 2  Scripts et traitement de fichiers par lots via Perl et Python   On s'entraine ici à produire des scripts un peu plus conséquents et à utiliser Perl et Python pour "enrober" des commandes qui traitent des listes de fichiers. On apprend aussi à exécuter des scripts en tache de fond avec nohup. Merci de cliquer  ici  pour accéder à cette séance.    Séance 3  Visualisation de données issues de mapping via R   L'affichage et la visualisation de données issues de mapping se font plus facilement avec des outils adaptés, comme par exemple le logiciel R avec ses nombreux packages et fonctions. Merci de cliquer  ici  pour accéder à cette séance.   Calendrier probable pour 2021   CELCAT M1 BV    jeudi 11/03/2021 salle G105 de 15 h à 18 h jeudi 18/03/2021 salle G105 de 13 h 30 à 16 h jeudi 25/03/2021 salle G105 de 13 h 30 à 16 h lundi 29/03/2021 salle G105 de 15 h à 18 h (comprend un cc) Examens corrigés des années passées :     année 2020.

 

 

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