Qu'est-ce que le GBSA ? GBSA est l'acronyme de Groupe de Bioinformatique Santé Angevin. A l'initative de V. Procaccio, le GBSA regroupe de façon plutôt informelle des acteurs de la santé (angevine) intéressés par la bioinformatique, ce qui inclut au moins, au sens large, des problématiques de "Big Data","Big Computing" et de biostatistiques en grande dimension... avec un intérêt tout particulier pour le traitement de données génomiques et génétiques, bien sûr. Un des intérêts du GBSA est de faire un état des lieux des besoins, des équipements et ressources humaines dans le domaine de la bioinformatique pour le pôle santé angevin. Par exemple la plateforme de génomique haut débit sera bientôt partagée entre CHU et université : la convention est en cours de signature (janvier 2016) et permettra l'utilisation des équipements hospitaliers et universitaires par toutes les équipes du pole santé. Cette plateforme aura aussi pour vocation de poursuivre son développement avec l'acquisition de nouveaux équipements et nouvelles technologies. Parmi les acteurs impliqués, il faut citer aussi la participation active de ICO (avec A. Morel et J. Dauvé) et de la DRCI du CHU (direction de la recherche clinique et innovation) avec la participation de P. Saulnier et ses collègues. Le projet de CGO (Cancéropole Grand Ouest) est sans doute un enjeu important pour le GBSA. Les réunions du GBSA ont lieu tous les deux ou trois mois. Voici la liste (alphabétique) sans doute encore incomplète des personnes qui se sont déclarées intéressées pour participer à ce groupe : Sandrine BERTRAIS Jérôme BOURSIER Céline BRIS Paul CALES Marie CHABBERT Juan Manuel CHAO DE LA BARCA Benoit DA MOTA Jonathan DAUVE Valérie DESQUIRET Marc FERRE David GOUDENEGE Virgine HOFFMAN Gilles HUNAULT Emmanuel JASPARD Claudine LANDES-DEVAUCHELLE Alain MOREL Vincent PROCACCIO Delphine PRUNIER-MIREBEAU Pascal REYNIER Alexa ROUEZ Patrick SAULNIER Valérie THEPOT SEEGERS En termes de ressources -- hors celles de nos laboratoires respectifs -- le GBSA dispose d'un accés particulier au nouveau serveur SGI du Data Center du CHU.... Documents liés aux réunions Réunion du 07 septembre 2016 Compte-rendu. [JPR] :   Présentation de l'équipe de bioinformatique de l'IRHS. [VH] :   Présentation de l'outil eKLIPse dédié à la prédiction de délétion dans l'ADNmt. [OG] :   Présentation du projet GIRCI Grand-Ouest REGOVAR. Réunion du 1er juin 2016 [CL] :   Topoisomérases [MW] :   Implémentation d'outils de priorisation... [DG] :   Pipeline NIOURK Exome Réunion du 1er mars 2016 Compte-rendu. [BDM] :   Big Data et High Performance Computing [JB] :   Projet MétaNutriNASH [DG] :   Pipeline diag NGS (niourk). Réunion du 8 décembre 2015 [GH] :     R en 15 minutes pour la bioinformatique [MF] :     Machine SANGER : caractéristiques de la machine ; liste des logiciels.

 

 

   Retour à la page principale de   (gH)