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Modules de Biostatistiques

Ecole Doctorale Biologie Santé

                    gilles.hunault "at" univ-angers.fr

 

image Stat                                                    Rappels sur les analyses statistiques en général (pdf)

 

Repères statistiques pour doctorants (html)

 

Choisissez le module :

 

image Stat 13

               
 
Module 1
        Initiation à la Biostatistique.
        Initiation au logiciel R (gratuit) et comparaison avec Excel.

 
Module 2
        Analyses de régression et de corrélation en Biostatistique.
        Compléments sur le logiciel R.

 

Remarques

Certaines images affichées sur cette page ont été trouvées sur Internet via Google / Images et ne sont peut-être pas libres de droit. D'autres proviennent de la galerie R.

Les énoncés et solutions des séances sont un complément aux cours théoriques et ne sont pas compréhensibles sans un minimum de connaissances en statistiques et en R. Consulter la page statgen pour trouver un cours adapté à votre niveau.

Certains exercices sont des copies autorisées d'exercices d'enseignements dirigés nantais (merci à Jean-Benoit Hardouin) qu'on trouvera à l'adresse http://je.anaqol.org/index.php?file=pharma1.php ; d'autres sont des adaptations d'exercices de l'ouvrage Biostatistics for the Biological and Health Sciences de Marc TRIOLA et Mario TRIOLA, que nous avons eu l'honneur de traduire pour les éditions Pearson.

Le logiciel R peut être téléchargé gratuitement sur le site du CRAN à l'adresse : http://cran.r-project.org/. Nos fonctions, francisées, sont disponibles à l'adresse : http://forge.info.univ-angers.fr/~gh/wstat/statgh.r et une page d'explication est nommée statgh.php. Une fois sous R, afin de les utiliser, on peut écrire, suivant les cas :

 


          
      # lecture sur internet     
          
      source("http://forge.info.univ-angers.fr/~gh/wstat/statgh.r",encoding="latin1")     
          
      ## lecture en local sur le disque D: (Windows)     
          
      ## source("D:/statgh.r")     
          
      ## lecture sur en local sur /home/cours/ (Linux)     
          
      ## source("/home/cours/statgh.r",encoding="latin1")     
          
          
          

 

En principe la commande R help.start() fournit une page Web avec de nombreuses aides en ligne. Si cette commande ne fonctionne pas, on trouvera la page d'aide sur le Web pour les fonctions R de base ici et la page d'aide sur le Web pour les fonctions R élémentaires en statistique là.

La longue liste des "packages" complémentaires (tout aussi gratuits) avec leur description est ici.

Pour profiter au mieux de R, il est conseillé d'utiliser l'interface RStudio.

 

Calendrier probable pour 2020

  Séance  

Module I     

  Séance  

Module II     

1/6   jeudi 19 mars 2020 à 14 h 1/5   jeudi 28 mai 2020 à 14 h
2/6   jeudi 26 mars 2020 à 14 h 2/5   jeudi 04 juin 2020 à 14 h
3/6   jeudi 02 avril 2020 à 14 h 3/5   jeudi 11 juin 2020 à 14 h
4/6   jeudi 09 avril 2020 à 14 h 4/5   jeudi 18 juin 2020 à 14 h
5/6   jeudi 16 avril 2020 à 14 h 5/5   jeudi 25 juin 2020 à 14 h
6/6   jeudi 30 avril 2020 à 14 h (5 séances seulement)

Toutes les séances ont lieu à la Faculté des Sciences d'Angers, boulevard Lavoisier, (batiment G, premier étage) pour une durée de 3 h.

Cliquer sur le lien suivant pour disposer de la carte de référence du logiciel R : R_reference.

 

Avant d'utiliser R à la Faculté des Sciences d'Angers, consultez la note locale sur R.

 

 

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