Code-source


00001     <?php     

00002     #    (gH)   -_-  genereXml.php  ;  TimeStamp (unix) : 29 Septembre 2012 vers 18:04     

00003          

00004     error_reporting(E_ALL | E_NOTICE | E_STRICT) ;     

00005          

00006     header('Content-type: text/xml');     

00007          

00008     $pId     = array() ;     

00009     $pClass  = array() ;     

00010     $pLength = array() ;     

00011     $pSeq    = array() ;     

00012          

00013     $pn   = 0 ;     

00014          

00015     # protéine 1     

00016     $pn++ ;     

00017     $pId[$pn]     = "A2ZDX4" ;     

00018     $pClass[$pn]  = 1 ;     

00019     $pSeq[$pn]   = "MEYQGQHGGHASSRADEHGNPAVTTGNAPTGMGAGHIQEPAREDKKTDGVLRRSGSSSSSSSSEDDGMGGRRKKGIKEKIKEKLPGGNKGNNQQQQQEHTTTTTGGAYGPQGHDTKIATGAHGGTAATTADAGGEKKGIVDKIKEKLPGQH" ;     

00020     $pLength[$pn] = strlen($pSeq[$pn]) ;     

00021          

00022     # protéine 2     

00023          

00024     $pn++ ;     

00025     $pId[$pn] = "A2ZDX6" ;     

00026     $pClass[$pn] = 1 ;     

00027     $pSeq[$pn] = "MENYQGQHGYGADRVDVYGNPVAGQYGGGATAPGGGHGVMGMGGHHAGAGGQFQPVKEEHKTGGILHRSGSSSSSSSSEDDGMGGRRKKGIKEKIKEKLPGGNKGNNHQQQQMMGNTGGAYGQQGHAGMTGAGTGTGVHGAEYGNTGEKKGFMDKIKEKLPGQH" ;     

00028     $pLength[$pn] = strlen($pSeq[$pn]) ;     

00029          

00030     # protéine 3     

00031          

00032     $pn++ ;     

00033     $pId[$pn] = "AAA33480" ;     

00034     $pClass[$pn] = 2 ;     

00035     $pSeq[$pn] = "MEDERNTQQHQGGEQAQDQENEVKDRGLLDSLLGRNKHDDQEKKNQQEEEELATGMEKVTVAEPDHKEEGHEAAEKKDSLLAKLHRTSSSSSSSSDDEEEEVIDENGEIVKRKKKGLKEKVKEKSAAHKAHDEGDHHQPGVPAPAPAPPVAVDTHAHHQEGEHKPHFPAPAPPPHVETHHPVVVHKIEDDDTKTQTPPQAPEEEKKGLLDKIKEKLPGGHKKPEDAAAAAAAPAVHAPPPPAPHAEVDVSSPDGKKGLLGKIMDKIPGYHKSSGEEDRKDAAGEHKTSS" ;     

00036     $pLength[$pn] = strlen($pSeq[$pn]) ;     

00037          

00038     # protéine 4     

00039          

00040     $pn++ ;     

00041     $pId[$pn] = "AAB18201" ;     

00042     $pClass[$pn] = 2 ;     

00043     $pSeq[$pn] = "MEDERSTQSYQGGEAAEQVEVTDRGLLGNLLGKKKAEEDKEKKEEELVTGMEKVSVEEPEVKKEEHVDGEKKETLFSKLHRSSSSSSSSSDEEEEEVIDDNGEVIKRKKKKGLKEKLQEKLPGHKDTEGEHVTALPAPAAPASVQTHHDTDVVVEKIDGDVKTEATPAVPEEEKKGFLEKIKEKLPGGHKKPEDAAAVPVTHAAPAPVTHAAPAPVHAPAPAAEEVSSPDAKEKKGLLGKIMDKLPGYHKTGEEDKAAAATGEHKPSA" ;     

00044     $pLength[$pn] = strlen($pSeq[$pn]) ;     

00045          

00046     # protéine 5     

00047          

00048     $pn++ ;     

00049     $pId[$pn] = "AAB18202" ;     

00050     $pClass[$pn] = 2 ;     

00051     $pSeq[$pn] = "MEDERSTQSYQGGEAAEQVEVTDRGLLGNLLGKKKAEEDKEKQEELVTGMEKVSVEEPEVKKEEHEDGEKKETLFSKLHRSSSSSSSSSDEEEEEVIDDNGEVIKRKKKKGLKEKLKEKLPGHKDTEGEHVTGLPAPAAPASVQTHHDTDVVVEKIDGDVKTEAAPAVPEEEKKGFLEKIKEKLPGGHKKPEDAAPVPVTHAAPAPVHAPAPAAEEVSSPDAKEKKGLLGKIMDKLPGYHKTGEEDKAAAAAGEHKPSA" ;     

00052     $pLength[$pn] = strlen($pSeq[$pn]) ;     

00053          

00054     $nbProt = $pn ;     

00055          

00056     $domtree = new DOMDocument('1.0', 'UTF-8');     

00057     $rootElt = $domtree->createElement("proteins");     

00058     $tmp     = $domtree->appendChild($rootElt);     

00059          

00060     for ($idp=1;$idp<=$nbProt;$idp++) {     

00061          

00062       $prot  = $domtree->createElement("protein"); # nouvel élément <protein>     

00063          

00064       if (isset($_GET["i"])) { # identifiant     

00065          if ($_GET["i"]=="e") {     

00066             $pi  = $domtree->createElement("identifiant",$pId[$idp]) ; # nouvel élément <identifiant>     

00067             $tmp = $prot->appendChild($pi);     

00068          } else {     

00069             $prot->setAttribute("identifiant",$pId[$idp]) ; # nouvel attribut identifiant     

00070          } # fin si sur élément ou attribut     

00071       } # fin si sur i     

00072          

00073       if (isset($_GET["c"])) { # classe     

00074          if ($_GET["c"]=="e") {     

00075              $pc  = $domtree->createElement("class",$pClass[$idp]) ;     

00076              $tmp = $prot->appendChild($pc);     

00077          } else {     

00078              $prot->setAttribute("class",$pClass[$idp]) ;     

00079          } # fin si sur élément ou attribut     

00080       } # fin si sur c     

00081          

00082       if (isset($_GET["l"])) { # longueur     

00083          if ($_GET["l"]=="e") {     

00084              $pl  = $domtree->createElement("longueur",$pLength[$idp]) ;     

00085              $tmp = $prot->appendChild($pl);     

00086          } else {     

00087              $prot->setAttribute("longueur",$pLength[$idp]) ;     

00088          } # fin si sur élément ou attribut     

00089       } # fin si sur c     

00090          

00091       if (isset($_GET["s"])) { # sequence     

00092          if ($_GET["s"]=="e") {     

00093             # une variante, sans doute moins lisible     

00094             $tmp = $prot->appendChild( $domtree->createElement("sequence",$pSeq[$idp]) ) ;     

00095          } else {     

00096              $prot->setAttribute("sequence",$pSeq[$idp]) ;     

00097          } # fin si sur élément ou attribut     

00098       } # fin si sur s     

00099          

00100       # ajout de la nouvelle protéines     

00101          

00102       $tmp = $rootElt->appendChild($prot);     

00103          

00104     } ; # fin pour idp     

00105          

00106     echo $domtree->saveXML();     

00107          

00108          

00109     ?>
Listing du fichier genereXml.php
