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Projet de programmation en Master 1 Informatique

(année 2016/2017)

 

Développement d'une interface de recherche/visualisation de données

en chimie moléculaire et quantique

 

Détails du projet

A l'université d'Angers, le laboratoire MOLTECH-Anjou (UMR CNRS-UA 6200) réalise des simulations informatiques sur des molécules en chimie quantique.

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Vu le grand nombre de simulations réalisées au premier janvier 2017 (plus de 3 000 simulations), il serait intéressant de disposer d'une interface Web pour :

- recenser les analyses déjà effectuées ;

- permettre de rechercher rapidement si une molécule a déjà été simulée ;

- visualiser finement les résultats d'une simulation pour une molécule donnée.

Données à traiter

On trouvera dans le fichier fichiersChimieQuantique.txt une liste de fichiers correspondant à des molécules déjà analysées avec les conditions d'analyse indiquées dans le nom du fichier.

Chaque fichier correspond à une molécule, une charge de -3 à +3, une multiplicité de 1 à 5, un nombre de fonctions de base, la force de répulsion et aux conditions d'analyse.

Par exemple pour le fichier à la ligne 11, soit AlCl3_-1_2_168_297.5327962349_Gas_SP_anion.txt :

  • la molécule est AlCL3, la charge est -1, la multiplicité 2,

  • le nombre de fonctions de base est 168,

  • la force de répulsion nucléaire est d'en gros 297.53 Hartreees,

  • la condition est Gas_SP_anion.

On commencera bien sûr par construire une base de données pour fournir des statistiques élémentaires de comptage sur les simulations et pour faciliter la recherche de molécules parmi les simulations.

Visualisation des résultats d'une simulation

Chaque simulation produit plusieurs fichiers dont la taille globale varie de 500 Mo à 1 Go. Des exemple de résultats de simulation seront fournis. On essaiera de produire rapidement/facilement des représentations et des visualisations statiques ou dynamiques "agréables" en pov, jpg, viewmol, jsmol...

 

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