Code-source


00001     <?php     

00002     #   # (gH)   -_-  proj_m1_2017_2.php  ;  TimeStamp (unix) : 19 Février 2017 vers 11:37     

00003          

00004     include("../../std.php") ;     

00005          

00006     $an1 = 2016 ;     

00007     $an2 = $an1 + 1;     

00008     debutPage("Projets en Master 1 Informatique an $an1/$an2","strict")  ;     

00009     debutSection() ;     

00010     pvide() ;     

00011          

00012     h1("Projet de programmation en Master 1 Informatique") ;     

00013     h1("(année  $an1/$an2)") ;     

00014     pvide() ;     

00015     h1("Développement d'un pipeline de mesure de distances phylogénétiques à partir de génomes complets","gvert") ;     

00016     pvide() ;     

00017          

00018     blockquote() ;     

00019          

00020     ##############################################################################     

00021     ##############################################################################     

00022          

00023     h2("Présentation du projet") ;     

00024          

00025     blockquote() ;     

00026          

00027     p("texte") ;     

00028     echo "Il s'agit d'un projet proposé par l'INRA d'Angers, équipe EmerSys." ;     

00029     finp() ;     

00030          

00031     p("texte") ;     

00032     echo "Le texte de la proposition de stage est dans le fichier " ;     

00033     echo href("sujet_ANI_KMERpar.doc").". " ;     

00034     finp() ;     

00035          

00036     p() ;     

00037     echo "Le pipeline, à écrire de préférence en PERL, doit permettre de&nbsp;:" ;     

00038     finp() ;     

00039          

00040     p() ;     

00041       echo "- calculer des ".b("ANI")." (Average Nucleotide Identity) entre génomes bactériens. Voir l'article  " ;     

00042       echo href("https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4256179/","PMC4256179") ;     

00043       echo " pour plus de détails. " ;     

00044     finp() ;     

00045          

00046     p() ;     

00047       echo "- calculer des ".b("pourcentage de Kmers partagés").". Voir le " ;     

00048       echo href("https://en.wikipedia.org/wiki/K-mer","wiki anglais")." sur la notion de k-mer." ;     

00049     finp() ;     

00050          

00051     p() ;     

00052       echo "- fournir des représentations graphiques en arbres et nuages de points via le logiciel ".ghRouge("R").". " ;     

00053     finp() ;     

00054          

00055     p() ;     

00056     echo "En fin de stage, ce pipeline sera intégré à une plate-forme ".href("https://fr.wikipedia.org/wiki/Galaxy_(bioinformatique)","Galaxy").". " ;     

00057     finp() ;     

00058          

00059     finblockquote() ;     

00060          

00061     ##############################################################################     

00062          

00063     p() ;     

00064     echo href("montresource.php?nomfic=proj_m1_2017_2.php","Code-source de la page","orange_stim nou")."." ;     

00065     finp() ;     

00066          

00067     ##############################################################################     

00068          

00069     finblockquote() ;     

00070     finSection() ;     

00071     finPage() ;     

00072     ?>
Pour ne pas voir les numéros de ligne, ajoutez &nl=non à la suite du nom du fichier.
Listing du fichier proj_m1_2017_2.php
