Caractérisation spécifique de groupes version 1.07
Table des matières cliquable
1. Caractérisations pour le dossier ra_rep2
2. Liste des colonnes de caractérisation pour ra_rep2
3. Classification restreinte aux colonnes de caractérisation pour ra_rep2
1. Caractérisations pour le dossier ra_rep2
Caractérisation du groupe 1 soit II.1
Aucune caractérisation du groupe n'est vue dans le fichier résultat du solveur.
Caractérisation du groupe 2 soit II.2
Aucune caractérisation du groupe n'est vue dans le fichier résultat du solveur.
Caractérisation du groupe 3 soit II.3
Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~16 ET ~76 ET 124 ET (~63|~61) ET (65|74).
Ce qui correspond aux données :
D(+)_Cellobiose = 0 et DL-Lactate = 0 et Saccharose = 1 et (Protocatechuate = 0 ou D-Gluconate = 0) et ((-)_Quinate = 1 ou DL-alpha-Amino-n-Butyrate_(=_4-Aminobutyrate) = 1)
Caractérisation du groupe 4 soit II.4
Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : (~52|30) ET (~33|63) ET (63|126) ET (~126|~45|30|64).
Ce qui correspond aux données :
(trans-Aconitate = 0 ou Dulcitol = 1) et (myo-Inositol = 0 ou Protocatechuate = 1) et (Protocatechuate = 1 ou Tween80 = 1) et (Tween80 = 0 ou Mucate = 0 ou Dulcitol = 1 ou p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate) = 1)
Caractérisation du groupe 5 soit II.5
Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~54 ET 63.
Ce qui correspond aux données :
Citrate = 0 et Protocatechuate = 1
Caractérisation du groupe 6 soit IetIII
Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : (~52|31) ET (~45|46|149) ET (64|76|114).
Ce qui correspond aux données :
(trans-Aconitate = 0 ou D-Tagatose = 1) et (Mucate = 0 ou L(+)_Tartrate = 1 ou Dulcitol = 1) et (p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate) = 1 ou DL-Lactate = 1 ou Sorbitol = 1)
Caractérisation du groupe 7 soit IV
Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~20 ET 99 ET (52|~81).
Ce qui correspond aux données :
D(-)_Ribose = 0 et alpha-Ketoglutarate_(=_2-Ketoglutarate,_2-Oxoglutarate) = 1 et (trans-Aconitate = 1 ou Fumarate = 0)
Il s'agit donc d'une caractérisation partielle seulement.
2. Liste des colonnes de caractérisation pour ra_rep2
Liste par numéro de groupe pour ra_rep2
Numéro Groupe Colonnes 1 II.1 2 II.2 3 II.3 16- 76- 124+ 63- 61- 65+ 74+ 4 II.4 52- 30+ 33- 63+ 126+ 45- 64+ 5 II.5 54- 63+ 6 IetIII 52- 31+ 45- 46+ 149+ 64+ 76+ 114+ 7 IV 20- 99+ 52+ 81- Liste par numéro de colonne pour ra_rep2
Indice Numéro Nom Groupe(s) 1 16 D(+)_Cellobiose 3- 2 20 D(-)_Ribose 7- 3 30 Dulcitol 4+ 4 31 D-Tagatose 6+ 5 33 myo-Inositol 4- 6 45 Mucate 4- 6- 7 46 L(+)_Tartrate 6+ 8 52 trans-Aconitate 4- 6- 7+ 9 54 Citrate 5- 10 61 D-Gluconate 3- 11 63 Protocatechuate 3- 4+ 5+ 12 64 p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate) 4+ 6+ 13 65 (-)_Quinate 3+ 14 74 DL-alpha-Amino-n-Butyrate_(=_4-Aminobutyrate) 3+ 15 76 DL-Lactate 3- 6+ 16 81 Fumarate 7- 17 99 alpha-Ketoglutarate_(=_2-Ketoglutarate,_2-Oxoglutarate) 7+ 18 114 Sorbitol 6+ 19 124 Saccharose 3+ 20 126 Tween80 4+ 4- 21 149 Dulcitol 6+ Matrice de présence/absence des souches, restreinte aux seules 21 colonnes impliquées
Format : Souche Groupe Caractères
3. Classification restreinte aux 21 colonnes de caractérisation pour ra_rep2
Avec une caractérisation partielle, il n'est pas possible de tracer une classification.
liste des analyses effectuées vérification des solutions
Retour à la page principale de (gH)