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Caractérisation spécifique de groupes version 1.07

Table des matières cliquable

1. Caractérisations pour le dossier ra_rep2

2. Liste des colonnes de caractérisation pour ra_rep2

3. Classification restreinte aux colonnes de caractérisation pour ra_rep2

1. Caractérisations pour le dossier ra_rep2

Caractérisation du groupe 1 soit II.1

Aucune caractérisation du groupe n'est vue dans le fichier résultat du solveur.

Caractérisation du groupe 2 soit II.2

Aucune caractérisation du groupe n'est vue dans le fichier résultat du solveur.

Caractérisation du groupe 3 soit II.3

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~16 ET ~76 ET 124 ET (~63|~61) ET (65|74).

Ce qui correspond aux données :

     D(+)_Cellobiose = 0 et DL-Lactate = 0 et Saccharose = 1 et (Protocatechuate = 0 ou D-Gluconate = 0) et ((-)_Quinate = 1 ou DL-alpha-Amino-n-Butyrate_(=_4-Aminobutyrate) = 1)

Caractérisation du groupe 4 soit II.4

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : (~52|30) ET (~33|63) ET (63|126) ET (~126|~45|30|64).

Ce qui correspond aux données :

     (trans-Aconitate = 0 ou Dulcitol = 1) et (myo-Inositol = 0 ou Protocatechuate = 1) et (Protocatechuate = 1 ou Tween80 = 1) et (Tween80 = 0 ou Mucate = 0 ou Dulcitol = 1 ou p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate) = 1)

Caractérisation du groupe 5 soit II.5

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~54 ET 63.

Ce qui correspond aux données :

     Citrate = 0 et Protocatechuate = 1

Caractérisation du groupe 6 soit IetIII

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : (~52|31) ET (~45|46|149) ET (64|76|114).

Ce qui correspond aux données :

     (trans-Aconitate = 0 ou D-Tagatose = 1) et (Mucate = 0 ou L(+)_Tartrate = 1 ou Dulcitol = 1) et (p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate) = 1 ou DL-Lactate = 1 ou Sorbitol = 1)

Caractérisation du groupe 7 soit IV

Une caractérisation du groupe est donnée par la formule : ~20 ET 99 ET (52|~81).

Ce qui correspond aux données :

     D(-)_Ribose = 0 et alpha-Ketoglutarate_(=_2-Ketoglutarate,_2-Oxoglutarate) = 1 et (trans-Aconitate = 1 ou Fumarate = 0)

Il s'agit donc d'une caractérisation partielle seulement.

2. Liste des colonnes de caractérisation pour ra_rep2

Liste par numéro de groupe pour ra_rep2

Numéro Groupe Colonnes
1      II.1
2      II.2
3      II.3 16-   76-   124+   63-   61-   65+   74+  
4      II.4 52-   30+   33-   63+   126+   45-   64+  
5      II.5 54-   63+  
6      IetIII 52-   31+   45-   46+   149+   64+   76+   114+  
7      IV 20-   99+   52+   81-  

Liste par numéro de colonne pour ra_rep2

Indice Numéro Nom Groupe(s)
1    16    D(+)_Cellobiose   3-  
2    20    D(-)_Ribose   7-  
3    30    Dulcitol   4+  
4    31    D-Tagatose   6+  
5    33    myo-Inositol   4-  
6    45    Mucate   4-   6-  
7    46    L(+)_Tartrate   6+  
8    52    trans-Aconitate   4-   6-   7+  
9    54    Citrate   5-  
10    61    D-Gluconate   3-  
11    63    Protocatechuate   3-   4+   5+  
12    64    p-Hydroxybenzoate_(=_4-Hydroxybenzoate)   4+   6+  
13    65    (-)_Quinate   3+  
14    74    DL-alpha-Amino-n-Butyrate_(=_4-Aminobutyrate)   3+  
15    76    DL-Lactate   3-   6+  
16    81    Fumarate   7-  
17    99    alpha-Ketoglutarate_(=_2-Ketoglutarate,_2-Oxoglutarate)   7+  
18    114    Sorbitol   6+  
19    124    Saccharose   3+  
20    126    Tween80   4+   4-  
21    149    Dulcitol   6+  

Matrice de présence/absence des souches, restreinte aux seules 21 colonnes impliquées

Format : Souche Groupe Caractères

3. Classification restreinte aux 21 colonnes de caractérisation pour ra_rep2

Avec une caractérisation partielle, il n'est pas possible de tracer une classification.

 

          liste des analyses effectuées          vérification des solutions

 

          Code-source de la page

 

 

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