Calculs de CCD (cli) version 1.01 pour rch7
Groupes Colonnes Lignes (données binaires avec indication de groupe) On travaille donc avec 132 individus, 37 colonnes et 18 groupes. Codes couleurs utilisés pour les pourcentages
0 % <= pct < 10 % jaune 10 % <= pct <= 90 % orange 90 % < pct <= 100 % rouge Description des groupes Num Nom Effectif Pourcentage Individus 1 alfalfae 5 3.8 % S3835G01 S3836G01 S3837G01 S7120G01 S7121G01 2 allii 10 7.6 % S6107G02 S6369G02 S6358G02 S6359G02 S6362G02 S6364G02 S6367G02 S6376G02 S6383G02 S6385G02 3 aurantifolii 5 3.8 % S3528G03 S3529G03 S3530G03 S2901G03 S2866G03 4 axonopodis 2 1.5 % S4924G04 S5141G04 5 begoniae 5 3.8 % S2524G05 S5677G05 S1421G05 S5676G05 S5678G05 6 citri 8 6.1 % S2525G06 S3369G06 S1209G06 S1814G06 S5280G06 S5284G06 S2900G06 S0306G06 7 citrumelo 6 4.5 % S3371G07 S3541G07 S3841G07 S3842G07 S3843G07 S3114G07 8 dieffenbachiae 5 3.8 % S3133G08 S3132G08 S5688G08 S5693G08 S5691G08 9 glycines 5 3.8 % S1519G09 S2526G09 S7119G09 S7118G09 S1559G09 10 malvacearum 5 3.8 % S2035G10 S2530G10 S5700G10 S5701G10 S5726G10 11 anacardii 6 4.5 % S2914G11 S2913G11 SJY542G11 SLA099G11 SLA100G11 SLA102G11 12 mangiferaeindicae 10 7.6 % S1716G12 S2933G12 SJN576G12 S2915G12 S2935G12 S2939G12 S2940G12 SJP742G12 SJP757G12 SJP740G12 13 manihotis 6 4.5 % S1860G13 S2603G13 S1851G13 S2624G13 S6544G13 S1865G13 14 Fuscans_NFi 30 22.7 % S1815G14 S4834G14 S6165G14 S6167G14 S6969G14 S6166G14 S6965G14 S6975G14 S6976G14 S6979G14 S1845G14 S6960G14 S6970G14 S6971G14 S2534G14 S6164G14 S6987G14 S6984G14 S6982G14 S0412G14 S6983G14 S6985G14 S6989G14 S6990G14 S6991G14 S6988G14 S6992G14 S6994G14 S6996G14 S6993G14 15 ricini 5 3.8 % S5863G15 S5864G15 S5865G15 S6541G15 S6542G15 16 vasculorum 7 5.3 % S1215G16 S5694G16 S5695G16 S5696G16 S5698G16 S5823G16 S1289G16 17 vesicatoria 7 5.3 % S1604G17 S5594G17 S5618G17 S75-3G17 S2484G17 S6864G17 S6817G17 18 vignicola 5 3.8 % S7110G18 S7111G18 S7112G18 S7113G18 S7115G18
Description globale des colonnes Numéro Colonne Nb_0 Pct_0 | Nb_1 Pct_1 1 XopF1 0 0 % | 132 100 % 2 XopN 3 2 % | 129 98 % 3 XopX 4 3 % | 128 97 % 4 HpaXac 0 0 % | 132 100 % 5 AvrBs2 0 0 % | 132 100 % 6 pthA1 3 2 % | 129 98 % 7 XopQ 17 13 % | 115 87 % 8 XopE2 13 10 % | 119 90 % 9 AvrXacE3 13 10 % | 119 90 % 10 XopF2 73 55 % | 59 45 % 11 XopP 47 36 % | 85 64 % 12 XopE1 69 52 % | 63 48 % 13 ecf 123 93 % | 9 7 % 14 XAC 66 50 % | 66 50 % 15 HpaF=XAC0393 91 69 % | 41 31 % 16 AvrXacE1 60 45 % | 72 55 % 17 XccA1 132 100 % | 0 0 % 18 XccA2 81 61 % | 51 39 % 19 HpaAXcc 132 100 % | 0 0 % 20 XccE1 118 89 % | 14 11 % 21 XccB 64 48 % | 68 52 % 22 AvrXacE2 66 50 % | 66 50 % 23 XopB 90 68 % | 42 32 % 24 XopD 125 95 % | 7 5 % 25 XopJ 124 94 % | 8 6 % 26 XopO 125 95 % | 7 5 % 27 AvrRxv 116 88 % | 16 12 % 28 AvrXv3 100 76 % | 32 24 % 29 XCC2565 132 100 % | 0 0 % 30 AvrRxo1 90 68 % | 42 32 % 31 XopA 123 93 % | 9 7 % 32 XopC 74 56 % | 58 44 % 33 AvrBsT 99 75 % | 33 25 % 34 AvrBs1 127 96 % | 5 4 % 35 AvrBs1.1 127 96 % | 5 4 % 36 AvrXv4 127 96 % | 5 4 % 37 XccC 117 89 % | 15 11 % Positivité des colonnes
100 % 98 % 97 % 100 % 100 % 98 % 87 % 90 % 90 % 45 % 64 % 48 % 7 % 50 % 31 % 55 % 0 % 39 % 0 % 11 % 52 % 50 % 32 % 5 % 6 % 5 % 12 % 24 % 0 % 32 % 7 % 44 % 25 % 4 % 4 % 4 % 11 % 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 XopF1 XopN XopX HpaXa AvrBs pthA1 XopQ XopE2 AvrXa XopF2 XopP XopE1 ecf XAC HpaF= AvrXa XccA1 XccA2 HpaAX XccE1 XccB AvrXa XopB XopD XopJ XopO AvrRx AvrXv XCC25 AvrRx XopA XopC AvrBs AvrBs AvrBs AvrXv XccC VALEUR DES CCD Colonne CCD Nom (NS=non significatif) 1 NS XopF1 2 0.125114 XopN 3 0.154169 XopX 4 NS HpaXac 5 NS AvrBs2 6 0.104244 pthA1 7 0.517326 XopQ 8 0.464174 XopE2 9 0.464174 AvrXacE3 10 0.816792 XopF2 11 0.912019 XopP 12 0.717497 XopE1 13 0.322323 ecf 14 0.947753 XAC 15 0.591181 HpaF=XAC0393 16 0.701051 AvrXacE1 17 NS XccA1 18 0.585069 XccA2 19 NS HpaAXcc 20 0.456541 XccE1 21 0.920623 XccB 22 0.737589 AvrXacE2 23 0.902393 XopB 24 0.299133 XopD 25 0.302500 XopJ 26 0.299133 XopO 27 0.497305 AvrRxv 28 0.799049 AvrXv3 29 NS XCC2565 30 0.712248 AvrRxo1 31 0.309933 XopA 32 0.609782 XopC 33 0.743123 AvrBsT 34 0.186709 AvrBs1 35 0.186709 AvrBs1.1 36 0.232481 AvrXv4 37 0.510788 XccC Rangement par ordre d'importance des CCD CCD Numéro Nom 0.9478 14 XAC 0.9206 21 XccB 0.9120 11 XopP 0.9024 23 XopB 0.8168 10 XopF2 0.7990 28 AvrXv3 0.7431 33 AvrBsT 0.7376 22 AvrXacE2 0.7175 12 XopE1 0.7122 30 AvrRxo1 0.7011 16 AvrXacE1 0.6098 32 XopC 0.5912 15 HpaF=XAC0393 0.5851 18 XccA2 0.5173 7 XopQ 0.5108 37 XccC 0.4973 27 AvrRxv 0.4642 8 XopE2 0.4642 9 AvrXacE3 0.4565 20 XccE1 0.3223 13 ecf 0.3099 31 XopA 0.3025 25 XopJ 0.2991 26 XopO 0.2991 24 XopD 0.2325 36 AvrXv4 0.1867 34 AvrBs1 0.1867 35 AvrBs1.1 0.1542 3 XopX 0.1251 2 XopN 0.1042 6 pthA1 pour les autres colonnes, le ccd vaut 0, ou moins de 0.0001 Seuil utilisé : (choix utilisateur) Liste des 31 colonnes retenues via ce seuil CCD Numéro Nom 0.9478 14 XAC 0.9206 21 XccB 0.9120 11 XopP 0.9024 23 XopB 0.8168 10 XopF2 0.7990 28 AvrXv3 0.7431 33 AvrBsT 0.7376 22 AvrXacE2 0.7175 12 XopE1 0.7122 30 AvrRxo1 0.7011 16 AvrXacE1 0.6098 32 XopC 0.5912 15 HpaF=XAC0393 0.5851 18 XccA2 0.5173 7 XopQ 0.5108 37 XccC 0.4973 27 AvrRxv 0.4642 8 XopE2 0.4642 9 AvrXacE3 0.4565 20 XccE1 0.3223 13 ecf 0.3099 31 XopA 0.3025 25 XopJ 0.2991 26 XopO 0.2991 24 XopD 0.2325 36 AvrXv4 0.1867 34 AvrBs1 0.1867 35 AvrBs1.1 0.1542 3 XopX 0.1251 2 XopN 0.1042 6 pthA1 Positivité de ces 31 colonnes par groupe en % : (laissez la souris sur les numéros de groupe et de colonne pour en avoir le nom) . Colonnes Groupe . 14 21 11 23 10 28 33 22 12 30 16 32 15 18 7 37 27 8 9 20 13 31 25 26 24 36 34 35 3 2 6 1 . 0 100 100 0 100 100 40 100 0 100 0 40 0 100 100 0 0 100 100 0 40 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 2 . 0 0 100 0 100 100 0 0 90 100 90 0 0 0 0 100 90 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 3 . 100 100 20 0 20 0 0 100 40 0 60 0 100 60 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 4 . 0 0 100 100 0 0 0 100 100 0 100 0 0 100 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 100 5 . 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 20 0 60 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 6 . 100 25 100 0 0 0 0 100 100 0 100 12 100 75 100 0 0 100 100 100 0 25 0 0 0 0 0 0 100 100 100 7 . 0 83 100 0 100 100 0 33 0 100 0 50 66 0 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 8 . 0 0 0 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0 20 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 9 . 100 0 0 0 0 0 0 100 100 0 100 100 100 100 60 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 10 . 100 0 100 0 0 0 0 100 100 0 100 100 0 100 100 0 0 100 100 0 0 0 20 0 0 0 0 0 100 100 100 11 . 0 100 100 100 0 0 0 100 0 0 0 0 100 0 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 33 100 100 12 . 100 100 0 100 0 0 0 100 100 0 100 100 0 0 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 13 . 0 0 0 0 0 100 0 0 0 100 0 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 14 . 100 100 100 0 83 0 100 60 33 26 60 70 33 50 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 15 . 0 0 100 0 100 0 0 0 100 0 100 0 0 0 0 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 100 16 . 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 85 100 17 . 42 0 100 100 100 0 14 0 100 100 100 100 42 0 100 0 100 100 100 85 100 100 100 100 100 0 71 71 100 100 57 18 . 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 60 0 0 100 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 100 0 0 100 100 100 tous . 50 51 64 31 44 24 25 50 47 31 54 43 31 38 87 11 12 90 90 10 6 6 6 5 5 3 3 3 96 97 97 Groupe . 14 21 11 23 10 28 33 22 12 30 16 32 15 18 7 37 27 8 9 20 13 31 25 26 24 36 34 35 3 2 6 Visualisation de la positivité de ces 31 colonnes par groupe :
Colonnes Groupe . 14 21 11 23 10 28 33 22 12 30 16 32 15 18 7 37 27 8 9 20 13 31 25 26 24 36 34 35 3 2 6 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 tous . Groupe . 14 21 11 23 10 28 33 22 12 30 16 32 15 18 7 37 27 8 9 20 13 31 25 26 24 36 34 35 3 2 6 ESSAI DE CARACTERISATION DES GROUPES (ccd>=) avec ces 31 colonnes Groupe 1 : alfalfae effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 1 : num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 1 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 2 : allii effectif 10 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 2 : num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 2 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 3 : aurantifolii effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 3 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 3 : num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 4 : axonopodis effectif 2 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 4 : num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 4 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN Groupe 5 : begoniae effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 5 : num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 5 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 6 : citri effectif 8 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 6 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 6 : num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 7 : citrumelo effectif 6 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 7 : num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 7 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 8 : dieffenbachiae effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 8 : num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 8 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 9 : glycines effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 9 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 9 : num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 10 : malvacearum effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 10 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 10 : num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 11 : anacardii effectif 6 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 11 : num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 11 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 12 : mangiferaeindicae effectif 10 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 12 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 12 : num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 13 : manihotis effectif 6 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 13 : num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 13 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 14 : Fuscans_NFi effectif 30 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 14 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 14 : num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 15 : ricini effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 15 : num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 15 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 16 : vasculorum effectif 7 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 16 : num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 16 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 Groupe 17 : vesicatoria effectif 7 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 17 : num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 32 ccd = 0.6098 nom = XopC num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 17 : num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 Groupe 18 : vignicola effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 18 : num = 21 ccd = 0.9206 nom = XccB num = 7 ccd = 0.5173 nom = XopQ num = 8 ccd = 0.4642 nom = XopE2 num = 9 ccd = 0.4642 nom = AvrXacE3 num = 36 ccd = 0.2325 nom = AvrXv4 num = 3 ccd = 0.1542 nom = XopX num = 2 ccd = 0.1251 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1042 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 18 : num = 14 ccd = 0.9478 nom = XAC num = 11 ccd = 0.9120 nom = XopP num = 23 ccd = 0.9024 nom = XopB num = 10 ccd = 0.8168 nom = XopF2 num = 28 ccd = 0.7990 nom = AvrXv3 num = 33 ccd = 0.7431 nom = AvrBsT num = 22 ccd = 0.7376 nom = AvrXacE2 num = 12 ccd = 0.7175 nom = XopE1 num = 30 ccd = 0.7122 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.7011 nom = AvrXacE1 num = 15 ccd = 0.5912 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.5851 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5108 nom = XccC num = 27 ccd = 0.4973 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4565 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3223 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3099 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3025 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.2991 nom = XopO num = 24 ccd = 0.2991 nom = XopD num = 34 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.1867 nom = AvrBs1.1 COLONNES SPECIFIQUES au sein de ces 31 colonnes la colonne 26 soit XopO caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 17 soit vesicatoria la colonne 24 soit XopD caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 17 soit vesicatoria la colonne 36 soit AvrXv4 caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 18 soit vignicola COLONNES IDENTIQUES au sein de ces 31 colonnes Egale(s) à la colonne 8 soit XopE2 : colonne 9 = AvrXacE3 ; Egale(s) à la colonne 26 soit XopO : colonne 24 = XopD ; Egale(s) à la colonne 34 soit AvrBs1 : colonne 35 = AvrBs1.1 ; COLONNES SEMBLABLES à 95 % au moins Semblable(s) à la colonne 13 soit ecf : colonne 31 à 97.0 % pour XopA ; colonne 25 à 97.7 % pour XopJ ; colonne 26 à 98.5 % pour XopO ; colonne 24 à 98.5 % pour XopD ; colonne 34 à 97.0 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 97.0 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 31 soit XopA : colonne 25 à 97.7 % pour XopJ ; colonne 26 à 98.5 % pour XopO ; colonne 24 à 98.5 % pour XopD ; colonne 34 à 97.0 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 97.0 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 25 soit XopJ : colonne 26 à 99.2 % pour XopO ; colonne 24 à 99.2 % pour XopD ; colonne 34 à 97.7 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 97.7 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 26 soit XopO : colonne 34 à 98.5 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 98.5 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 24 soit XopD : colonne 34 à 98.5 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 98.5 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 2 soit XopN : colonne 6 à 95.5 % pour pthA1 ; LIGNES EGALES SUR 37 COLONNES (numéro de ligne entre parenthèses) Num Nb Individus 1 2 ( 2) S3836G01 = S7121G01 ( 5) ; 2 8 ( 6) S6107G02 = S6369G02 ( 7) ; S6358G02 ( 8) ; S6359G02 ( 9) ; S6362G02 ( 10) ; S6367G02 ( 12) ; S6376G02 ( 13) ; S6383G02 ( 14) ; 3 2 ( 17) S3529G03 = S2901G03 ( 19) ; 4 2 ( 21) S4924G04 = S5141G04 ( 22) ; 5 2 ( 24) S5677G05 = S1421G05 ( 25) ; 6 2 ( 26) S5676G05 = S5678G05 ( 27) ; 7 3 ( 30) S1209G06 = S5280G06 ( 32) ; S5284G06 ( 33) ; 8 2 ( 34) S2900G06 = S0306G06 ( 35) ; 9 2 ( 36) S3371G07 = S3843G07 ( 40) ; 10 2 ( 37) S3541G07 = S3841G07 ( 38) ; 11 4 ( 42) S3133G08 = S5688G08 ( 44) ; S5693G08 ( 45) ; S5691G08 ( 46) ; 12 3 ( 47) S1519G09 = S2526G09 ( 48) ; S1559G09 ( 51) ; 13 2 ( 49) S7119G09 = S7118G09 ( 50) ; 14 4 ( 52) S2035G10 = S2530G10 ( 53) ; S5701G10 ( 55) ; S5726G10 ( 56) ; 15 2 ( 57) S2914G11 = S2913G11 ( 58) ; 16 4 ( 59) SJY542G11 = SLA099G11 ( 60) ; SLA100G11 ( 61) ; SLA102G11 ( 62) ; 17 10 ( 63) S1716G12 = S2933G12 ( 64) ; SJN576G12 ( 65) ; S2915G12 ( 66) ; S2935G12 ( 67) ; S2939G12 ( 68) ; S2940G12 ( 69) ; SJP742G12 ( 70) ; SJP757G12 ( 71) ; SJP740G12 ( 72) ; 18 6 ( 73) S1860G13 = S2603G13 ( 74) ; S1851G13 ( 75) ; S2624G13 ( 76) ; S6544G13 ( 77) ; S1865G13 ( 78) ; 19 3 ( 80) S4834G14 = S6165G14 ( 81) ; S6167G14 ( 82) ; 20 2 ( 83) S6969G14 = S6965G14 ( 85) ; 21 4 ( 84) S6166G14 = S6975G14 ( 86) ; S6976G14 ( 87) ; S6979G14 ( 88) ; 22 2 ( 90) S6960G14 = S6971G14 ( 92) ; 23 5 ( 93) S2534G14 = S6164G14 ( 94) ; S6987G14 ( 95) ; S6983G14 ( 99) ; S6985G14 (100) ; 24 2 ( 96) S6984G14 = S6982G14 ( 97) ; 25 3 (101) S6989G14 = S6990G14 (102) ; S6991G14 (103) ; 26 2 (105) S6992G14 = S6993G14 (108) ; 27 2 (106) S6994G14 = S6996G14 (107) ; 28 5 (109) S5863G15 = S5864G15 (110) ; S5865G15 (111) ; S6541G15 (112) ; S6542G15 (113) ; 29 6 (114) S1215G16 = S5694G16 (115) ; S5695G16 (116) ; S5696G16 (117) ; S5698G16 (118) ; S1289G16 (120) ; 30 2 (123) S5618G17 = S6864G17 (126) ; 31 2 (128) S7110G18 = S7112G18 (130) ; 32 3 (129) S7111G18 = S7113G18 (131) ; S7115G18 (132) ; Données initiales au format compressé (IDP) pour Wcabiq/classification ; faire CTRL-A pour tout sélectionner ANALYSE RESTREINTE AUX 31 COLONNES RETENUES Rappel des colonnes utilisées Matrice des fréquences de positivité pour Wcabiq/identification ; faire CTRL-A pour tout sélectionner Test du pouvoir d'identification des 31 colonnes retenues Résultats d'identification au final 132 bien classés sur 132 soit 100.0 % 0 mal classés sur 132 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 67 bien classés sur 132 soit 50.8 % 65 mal classés sur 132 soit 49.2 % Résultats d'identification par groupe Groupe 1 soit alfalfae effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3835G01 1 1 1 100.0 44.4 1 1 1 0 0 0 1 S3836G01 1 1 1 100.0 66.7 2 1 2 0 0 0 2 S3837G01 1 1 1 100.0 66.7 3 1 3 0 0 0 3 S7120G01 1 1 1 100.0 66.7 4 1 4 0 0 0 4 S7121G01 1 1 1 100.0 66.7 5 1 5 0 0 0 5 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 0 bien classés validés sur 5 soit 0.0 % 5 mal classés validés sur 5 soit 100.0 % Groupe 2 soit allii effectif 10 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S6107G02 1 2 2 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S6369G02 1 2 2 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S6358G02 1 2 2 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6359G02 1 2 2 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6362G02 1 2 2 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S6364G02 1 2 2 100.0 1.2 6 1 6 0 0 5 1 S6367G02 1 2 2 100.0 100.0 7 1 7 0 1 6 1 S6376G02 1 2 2 100.0 100.0 8 1 8 0 1 7 1 S6383G02 1 2 2 100.0 100.0 9 1 9 0 1 8 1 S6385G02 1 2 2 100.0 11.1 10 1 10 0 0 8 2 10 bien classés sur 10 soit 100.0 % 0 mal classés sur 10 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 8 bien classés validés sur 10 soit 80.0 % 2 mal classés validés sur 10 soit 20.0 % Groupe 3 soit aurantifolii effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3528G03 1 3 3 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S3529G03 1 3 3 100.0 44.4 2 1 2 0 0 1 1 S3530G03 1 3 3 100.0 66.7 3 1 3 0 0 1 2 S2901G03 1 3 3 100.0 44.4 4 1 4 0 0 1 3 S2866G03 1 3 3 100.0 4.2 5 1 5 0 0 1 4 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 1 bien classés validés sur 5 soit 20.0 % 4 mal classés validés sur 5 soit 80.0 % Groupe 4 soit axonopodis effectif 2 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S4924G04 1 4 4 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S5141G04 1 4 4 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 2 bien classés sur 2 soit 100.0 % 0 mal classés sur 2 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 2 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 2 soit 0.0 % Groupe 5 soit begoniae effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2524G05 1 5 5 100.0 25.0 1 1 1 0 0 0 1 S5677G05 1 5 5 100.0 100.0 2 1 2 0 1 1 1 S1421G05 1 5 5 100.0 100.0 3 1 3 0 1 2 1 S5676G05 1 5 5 100.0 66.7 4 1 4 0 0 2 2 S5678G05 1 5 5 100.0 66.7 5 1 5 0 0 2 3 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 5 soit 40.0 % 3 mal classés validés sur 5 soit 60.0 % Groupe 6 soit citri effectif 8 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2525G06 1 6 6 100.0 4.8 1 1 1 0 0 0 1 S3369G06 1 6 6 100.0 11.1 2 1 2 0 0 0 2 S1209G06 1 6 6 100.0 100.0 3 1 3 0 1 1 2 S1814G06 1 6 6 100.0 33.3 4 1 4 0 0 1 3 S5280G06 1 6 6 100.0 100.0 5 1 5 0 1 2 3 S5284G06 1 6 6 100.0 100.0 6 1 6 0 1 3 3 S2900G06 1 6 6 100.0 33.3 7 1 7 0 0 3 4 S0306G06 1 6 6 100.0 33.3 8 1 8 0 0 3 5 8 bien classés sur 8 soit 100.0 % 0 mal classés sur 8 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés validés sur 8 soit 37.5 % 5 mal classés validés sur 8 soit 62.5 % Groupe 7 soit citrumelo effectif 6 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3371G07 1 7 7 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S3541G07 1 7 7 100.0 50.0 2 1 2 0 0 1 1 S3841G07 1 7 7 100.0 50.0 3 1 3 0 0 1 2 S3842G07 1 7 7 100.0 50.0 4 1 4 0 0 1 3 S3843G07 1 7 7 100.0 100.0 5 1 5 0 1 2 3 S3114G07 1 7 7 100.0 10.0 6 1 6 0 0 2 4 6 bien classés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés sur 6 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 6 soit 33.3 % 4 mal classés validés sur 6 soit 66.7 % Groupe 8 soit dieffenbachiae effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3133G08 1 8 8 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S3132G08 1 8 8 100.0 25.0 2 1 2 0 0 1 1 S5688G08 1 8 8 100.0 100.0 3 1 3 0 1 2 1 S5693G08 1 8 8 100.0 100.0 4 1 4 0 1 3 1 S5691G08 1 8 8 100.0 100.0 5 1 5 0 1 4 1 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 5 soit 80.0 % 1 mal classés validés sur 5 soit 20.0 % Groupe 9 soit glycines effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1519G09 1 9 9 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2526G09 1 9 9 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S7119G09 1 9 9 100.0 66.7 3 1 3 0 0 2 1 S7118G09 1 9 9 100.0 66.7 4 1 4 0 0 2 2 S1559G09 1 9 9 100.0 100.0 5 1 5 0 1 3 2 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés validés sur 5 soit 60.0 % 2 mal classés validés sur 5 soit 40.0 % Groupe 10 soit malvacearum effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2035G10 1 10 10 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2530G10 1 10 10 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S5700G10 1 10 10 100.0 25.0 3 1 3 0 0 2 1 S5701G10 1 10 10 100.0 100.0 4 1 4 0 1 3 1 S5726G10 1 10 10 100.0 100.0 5 1 5 0 1 4 1 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 5 soit 80.0 % 1 mal classés validés sur 5 soit 20.0 % Groupe 11 soit anacardii effectif 6 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2914G11 1 11 11 100.0 50.0 1 1 1 0 0 0 1 S2913G11 1 11 11 100.0 50.0 2 1 2 0 0 0 2 SJY542G11 1 11 11 100.0 100.0 3 1 3 0 1 1 2 SLA099G11 1 11 11 100.0 100.0 4 1 4 0 1 2 2 SLA100G11 1 11 11 100.0 100.0 5 1 5 0 1 3 2 SLA102G11 1 11 11 100.0 100.0 6 1 6 0 1 4 2 6 bien classés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés sur 6 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 6 soit 66.7 % 2 mal classés validés sur 6 soit 33.3 % Groupe 12 soit mangiferaeindicae effectif 10 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1716G12 1 12 12 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2933G12 1 12 12 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 SJN576G12 1 12 12 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S2915G12 1 12 12 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S2935G12 1 12 12 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S2939G12 1 12 12 100.0 100.0 6 1 6 0 1 6 0 S2940G12 1 12 12 100.0 100.0 7 1 7 0 1 7 0 SJP742G12 1 12 12 100.0 100.0 8 1 8 0 1 8 0 SJP757G12 1 12 12 100.0 100.0 9 1 9 0 1 9 0 SJP740G12 1 12 12 100.0 100.0 10 1 10 0 1 10 0 10 bien classés sur 10 soit 100.0 % 0 mal classés sur 10 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 10 bien classés validés sur 10 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 10 soit 0.0 % Groupe 13 soit manihotis effectif 6 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1860G13 1 13 13 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2603G13 1 13 13 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S1851G13 1 13 13 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S2624G13 1 13 13 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6544G13 1 13 13 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S1865G13 1 13 13 100.0 100.0 6 1 6 0 1 6 0 6 bien classés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés sur 6 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 6 bien classés validés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 6 soit 0.0 % Groupe 14 soit Fuscans_NFi effectif 30 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1815G14 1 14 14 100.0 10.0 1 1 1 0 0 0 1 S4834G14 1 14 14 100.0 25.0 2 1 2 0 0 0 2 S6165G14 1 14 14 100.0 25.0 3 1 3 0 0 0 3 S6167G14 1 14 14 100.0 25.0 4 1 4 0 0 0 4 S6969G14 1 14 14 100.0 50.0 5 1 5 0 0 0 5 S6166G14 1 14 14 100.0 100.0 6 1 6 0 1 1 5 S6965G14 1 14 14 100.0 50.0 7 1 7 0 0 1 6 S6975G14 1 14 14 100.0 100.0 8 1 8 0 1 2 6 S6976G14 1 14 14 100.0 100.0 9 1 9 0 1 3 6 S6979G14 1 14 14 100.0 100.0 10 1 10 0 1 4 6 S1845G14 1 14 14 100.0 10.0 11 1 11 0 0 4 7 S6960G14 1 14 14 100.0 25.0 12 1 12 0 0 4 8 S6970G14 1 14 14 100.0 5.0 13 1 13 0 0 4 9 S6971G14 1 14 14 100.0 25.0 14 1 14 0 0 4 10 S2534G14 1 14 14 100.0 16.2 15 1 15 0 0 4 11 S6164G14 1 14 14 100.0 16.2 16 1 16 0 0 4 12 S6987G14 1 14 14 100.0 16.2 17 1 17 0 0 4 13 S6984G14 1 14 14 100.0 16.2 18 1 18 0 0 4 14 S6982G14 1 14 14 100.0 16.2 19 1 19 0 0 4 15 S0412G14 1 14 14 100.0 1.4 20 1 20 0 0 4 16 S6983G14 1 14 14 100.0 16.2 21 1 21 0 0 4 17 S6985G14 1 14 14 100.0 16.2 22 1 22 0 0 4 18 S6989G14 1 14 14 100.0 42.9 23 1 23 0 0 4 19 S6990G14 1 14 14 100.0 42.9 24 1 24 0 0 4 20 S6991G14 1 14 14 100.0 42.9 25 1 25 0 0 4 21 S6988G14 1 14 14 100.0 8.6 26 1 26 0 0 4 22 S6992G14 1 14 14 100.0 9.5 27 1 27 0 0 4 23 S6994G14 1 14 14 100.0 9.5 28 1 28 0 0 4 24 S6996G14 1 14 14 100.0 9.5 29 1 29 0 0 4 25 S6993G14 1 14 14 100.0 9.5 30 1 30 0 0 4 26 30 bien classés sur 30 soit 100.0 % 0 mal classés sur 30 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 30 soit 13.3 % 26 mal classés validés sur 30 soit 86.7 % Groupe 15 soit ricini effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S5863G15 1 15 15 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S5864G15 1 15 15 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S5865G15 1 15 15 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6541G15 1 15 15 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6542G15 1 15 15 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 5 bien classés validés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 5 soit 0.0 % Groupe 16 soit vasculorum effectif 7 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1215G16 1 16 16 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S5694G16 1 16 16 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S5695G16 1 16 16 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S5696G16 1 16 16 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S5698G16 1 16 16 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S5823G16 1 16 16 100.0 16.7 6 1 6 0 0 5 1 S1289G16 1 16 16 100.0 100.0 7 1 7 0 1 6 1 7 bien classés sur 7 soit 100.0 % 0 mal classés sur 7 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 6 bien classés validés sur 7 soit 85.7 % 1 mal classés validés sur 7 soit 14.3 % Groupe 17 soit vesicatoria effectif 7 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1604G17 1 17 17 100.0 75.0 1 1 1 0 0 0 1 S5594G17 1 17 17 100.0 16.0 2 1 2 0 0 0 2 S5618G17 1 17 17 100.0 42.2 3 1 3 0 0 0 3 S75-3G17 1 17 17 100.0 16.7 4 1 4 0 0 0 4 S2484G17 1 17 17 100.0 56.2 5 1 5 0 0 0 5 S6864G17 1 17 17 100.0 42.2 6 1 6 0 0 0 6 S6817G17 1 17 17 100.0 2.7 7 1 7 0 0 0 7 7 bien classés sur 7 soit 100.0 % 0 mal classés sur 7 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 0 bien classés validés sur 7 soit 0.0 % 7 mal classés validés sur 7 soit 100.0 % Groupe 18 soit vignicola effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S7110G18 1 18 18 100.0 66.7 1 1 1 0 0 0 1 S7111G18 1 18 18 100.0 100.0 2 1 2 0 1 1 1 S7112G18 1 18 18 100.0 66.7 3 1 3 0 0 1 2 S7113G18 1 18 18 100.0 100.0 4 1 4 0 1 2 2 S7115G18 1 18 18 100.0 100.0 5 1 5 0 1 3 2 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés sur 5 soit 60.0 % 2 mal classés sur 5 soit 40.0 % Résumé des identifications par groupe Numéro Groupe Effectif % BC % BCV 1 alfalfae 5 100 0 2 allii 10 100 80 3 aurantifolii 5 100 20 4 axonopodis 2 100 100 5 begoniae 5 100 40 6 citri 8 100 37 7 citrumelo 6 100 33 8 dieffenbachiae 5 100 80 9 glycines 5 100 60 10 malvacearum 5 100 80 11 anacardii 6 100 66 12 mangiferaeindicae 10 100 100 13 manihotis 6 100 100 14 Fuscans_NFi 30 100 13 15 ricini 5 100 100 16 vasculorum 7 100 85 17 vesicatoria 7 100 0 18 vignicola 5 100 60 -- fin des calculs, version 1.51
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