Calculs de CCD (cli) version 1.01 pour rch4
Groupes Colonnes Lignes (données binaires avec indication de groupe) On travaille donc avec 118 individus, 37 colonnes et 19 groupes. Codes couleurs utilisés pour les pourcentages
0 % <= pct < 10 % jaune 10 % <= pct <= 90 % orange 90 % < pct <= 100 % rouge Description des groupes Num Nom Effectif Pourcentage Individus 1 alfalfae 5 4.2 % S3835G1 S3836G1 S3837G1 S7120G1 S7121G1 2 allii 10 8.5 % S6107G2 S6369G2 S6358G2 S6359G2 S6362G2 S6364G2 S6367G2 S6376G2 S6383G2 S6385G2 3 aurantifoli 5 4.2 % S3528G3 S3529G3 S3530G3 S2901G3 S2866G3 4 axonopodis 2 1.7 % S4924G4 S5141G4 5 begoniae 5 4.2 % S2524G5 S5677G5 S1421G5 S5676G5 S5678G5 6 citri 8 6.8 % S2525G6 S3369G6 S1209G6 S1814G6 S5280G6 S5284G6 S2900G6 S0306G6 7 citrumelo 6 5.1 % S3371G7 S3541G7 S3841G7 S3842G7 S3843G7 S3114G7 8 dieffenbach 5 4.2 % S3133G8 S3132G8 S5688G8 S5693G8 S5691G8 9 glycines 5 4.2 % S1519G9 S2526G9 S7119G9 S7118G9 S1559G9 10 malvacearum 5 4.2 % S2035G10 S2530G10 S5700G10 S5701G10 S5726G10 11 manihotis 6 5.1 % S1860G11 S2603G11 S1851G11 S2624G11 S6544G11 S1865G11 12 Fuscans 14 11.9 % S1815G12 S4834G12 S6165G12 S6167G12 S6969G12 S6166G12 S6965G12 S6975G12 S6976G12 S6979G12 S1845G12 S6960G12 S6970G12 S6971G12 13 NF1 8 6.8 % S2534G13 S6164G13 S6987G13 S6984G13 S6982G13 S0412G13 S6983G13 S6985G13 14 NF2 4 3.4 % S6989G14 S6990G14 S6991G14 S6988G14 15 NF3 4 3.4 % S6992G15 S6994G15 S6996G15 S6993G15 16 ricini 5 4.2 % S5863G16 S5864G16 S5865G16 S6541G16 S6542G16 17 vasculorum 9 7.6 % S5830G17 S1215G17 S5694G17 S5695G17 S5696G17 S5698G17 S5823G17 S5831G17 S1289G17 18 vesicatoria 7 5.9 % S1604G18 S5594G18 S5618G18 S0000G18 S2484G18 S6864G18 S6817G18 19 vignicola 5 4.2 % S7110G19 S7111G19 S7112G19 S7113G19 S7115G19
Description globale des colonnes Numéro Colonne Nb_0 Pct_0 | Nb_1 Pct_1 1 XopF1 0 0 % | 118 100 % 2 XopN 4 3 % | 114 97 % 3 XopX 0 0 % | 118 100 % 4 HpaXac 0 0 % | 118 100 % 5 AvrBs2 0 0 % | 118 100 % 6 pthA1 3 3 % | 115 97 % 7 XopQ 17 14 % | 101 86 % 8 XopE2 15 13 % | 103 87 % 9 AvrXacE3 15 13 % | 103 87 % 10 XopF2 59 50 % | 59 50 % 11 XopP 39 33 % | 79 67 % 12 XopE1 65 55 % | 53 45 % 13 ecf 109 92 % | 9 8 % 14 XAC 62 53 % | 56 47 % 15 HpaF=XAC0393 83 70 % | 35 30 % 16 AvrXacE1 56 47 % | 62 53 % 17 XccA1 118 100 % | 0 0 % 18 XccA2 67 57 % | 51 43 % 19 HpaAXcc 118 100 % | 0 0 % 20 XccE1 104 88 % | 14 12 % 21 XccB 66 56 % | 52 44 % 22 AvrXacE2 68 58 % | 50 42 % 23 XopB 90 76 % | 28 24 % 24 XopD 111 94 % | 7 6 % 25 XopJ 110 93 % | 8 7 % 26 XopO 111 94 % | 7 6 % 27 AvrRxv 102 86 % | 16 14 % 28 AvrXv3 86 73 % | 32 27 % 29 XCC2565 118 100 % | 0 0 % 30 AvrRxo1 76 64 % | 42 36 % 31 XopA 109 92 % | 9 8 % 32 XopC 70 59 % | 48 41 % 33 AvrBsT 85 72 % | 33 28 % 34 AvrBs1 113 96 % | 5 4 % 35 AvrBs1.1 113 96 % | 5 4 % 36 AvrXv4 113 96 % | 5 4 % 37 XccC 103 87 % | 15 13 % Positivité des colonnes
100 % 97 % 100 % 100 % 100 % 97 % 86 % 87 % 87 % 50 % 67 % 45 % 8 % 47 % 30 % 53 % 0 % 43 % 0 % 12 % 44 % 42 % 24 % 6 % 7 % 6 % 14 % 27 % 0 % 36 % 8 % 41 % 28 % 4 % 4 % 4 % 13 % 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 XopF1 XopN XopX HpaXa AvrBs pthA1 XopQ XopE2 AvrXa XopF2 XopP XopE1 ecf XAC HpaF= AvrXa XccA1 XccA2 HpaAX XccE1 XccB AvrXa XopB XopD XopJ XopO AvrRx AvrXv XCC25 AvrRx XopA XopC AvrBs AvrBs AvrBs AvrXv XccC VALEUR DES CCD Colonne CCD Nom (NS=non significatif) 1 NS XopF1 2 0.155293 XopN 3 NS XopX 4 NS HpaXac 5 NS AvrBs2 6 0.112449 pthA1 7 0.553652 XopQ 8 0.549483 XopE2 9 0.549483 AvrXacE3 10 0.816122 XopF2 11 0.884855 XopP 12 0.809236 XopE1 13 0.347760 ecf 14 0.939688 XAC 15 0.655077 HpaF=XAC0393 16 0.917247 AvrXacE1 17 NS XccA1 18 0.617811 XccA2 19 NS HpaAXcc 20 0.490351 XccE1 21 0.901768 XccB 22 0.936456 AvrXacE2 23 0.790501 XopB 24 0.324748 XopD 25 0.327057 XopJ 26 0.324748 XopO 27 0.532835 AvrRxv 28 0.843162 AvrXv3 29 NS XCC2565 30 0.939255 AvrRxo1 31 0.333900 XopA 32 0.737353 XopC 33 0.778747 AvrBsT 34 0.201866 AvrBs1 35 0.201866 AvrBs1.1 36 0.253068 AvrXv4 37 0.549483 XccC Rangement par ordre d'importance des CCD CCD Numéro Nom 0.9397 14 XAC 0.9393 30 AvrRxo1 0.9365 22 AvrXacE2 0.9172 16 AvrXacE1 0.9018 21 XccB 0.8849 11 XopP 0.8432 28 AvrXv3 0.8161 10 XopF2 0.8092 12 XopE1 0.7905 23 XopB 0.7787 33 AvrBsT 0.7374 32 XopC 0.6551 15 HpaF=XAC0393 0.6178 18 XccA2 0.5537 7 XopQ 0.5495 37 XccC 0.5495 9 AvrXacE3 0.5495 8 XopE2 0.5328 27 AvrRxv 0.4904 20 XccE1 0.3478 13 ecf 0.3339 31 XopA 0.3271 25 XopJ 0.3247 26 XopO 0.3247 24 XopD 0.2531 36 AvrXv4 0.2019 34 AvrBs1 0.2019 35 AvrBs1.1 0.1553 2 XopN 0.1124 6 pthA1 pour les autres colonnes, le ccd vaut 0, ou moins de 0.0001 Seuil utilisé : (choix utilisateur) Liste des 30 colonnes retenues via ce seuil CCD Numéro Nom 0.9397 14 XAC 0.9393 30 AvrRxo1 0.9365 22 AvrXacE2 0.9172 16 AvrXacE1 0.9018 21 XccB 0.8849 11 XopP 0.8432 28 AvrXv3 0.8161 10 XopF2 0.8092 12 XopE1 0.7905 23 XopB 0.7787 33 AvrBsT 0.7374 32 XopC 0.6551 15 HpaF=XAC0393 0.6178 18 XccA2 0.5537 7 XopQ 0.5495 37 XccC 0.5495 9 AvrXacE3 0.5495 8 XopE2 0.5328 27 AvrRxv 0.4904 20 XccE1 0.3478 13 ecf 0.3339 31 XopA 0.3271 25 XopJ 0.3247 26 XopO 0.3247 24 XopD 0.2531 36 AvrXv4 0.2019 34 AvrBs1 0.2019 35 AvrBs1.1 0.1553 2 XopN 0.1124 6 pthA1 Positivité de ces 30 colonnes par groupe en % : (laissez la souris sur les numéros de groupe et de colonne pour en avoir le nom) . Colonnes Groupe . 14 30 22 16 21 11 28 10 12 23 33 32 15 18 7 37 9 8 27 20 13 31 25 26 24 36 34 35 2 6 1 . 0 100 100 0 100 100 100 100 0 0 40 40 0 100 100 0 100 100 0 0 40 0 0 0 0 0 0 0 100 100 2 . 0 100 0 90 0 100 100 100 90 0 0 0 0 0 0 100 100 100 90 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 3 . 100 0 100 60 100 20 0 20 40 0 0 0 100 60 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 4 . 0 0 100 100 0 100 0 0 100 100 0 0 0 100 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 5 . 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 20 0 60 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 6 . 100 0 100 100 25 100 0 0 100 0 0 12 100 75 100 0 100 100 0 100 0 25 0 0 0 0 0 0 100 100 7 . 0 100 33 0 83 100 100 100 0 0 0 50 66 0 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 8 . 0 0 0 0 0 0 100 0 0 100 0 0 0 20 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 9 . 100 0 100 100 0 0 0 0 100 0 0 100 100 100 60 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 10 . 100 0 100 100 0 100 0 0 100 0 0 100 0 100 100 0 100 100 0 0 0 0 20 0 0 0 0 0 100 100 11 . 0 100 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 12 . 100 0 100 100 100 100 0 78 71 0 100 100 42 71 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 13 . 100 100 0 0 100 100 0 87 0 0 100 87 0 37 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 14 . 100 0 100 100 100 100 0 75 0 0 100 0 0 0 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 15 . 100 0 0 0 100 100 0 100 0 0 100 0 100 50 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 16 . 0 0 0 100 0 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 100 100 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 100 17 . 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 77 100 18 . 42 100 0 100 0 100 0 100 100 100 14 100 42 0 100 0 100 100 100 85 100 100 100 100 100 0 71 71 100 57 19 . 0 0 0 0 100 0 0 0 0 0 0 60 0 0 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 100 100 tous . 47 35 42 52 44 66 27 50 44 23 27 40 29 43 85 12 87 87 13 11 7 7 6 5 5 4 4 4 96 97 Groupe . 14 30 22 16 21 11 28 10 12 23 33 32 15 18 7 37 9 8 27 20 13 31 25 26 24 36 34 35 2 6 Visualisation de la positivité de ces 30 colonnes par groupe :
Colonnes Groupe . 14 30 22 16 21 11 28 10 12 23 33 32 15 18 7 37 9 8 27 20 13 31 25 26 24 36 34 35 2 6 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 tous . Groupe . 14 30 22 16 21 11 28 10 12 23 33 32 15 18 7 37 9 8 27 20 13 31 25 26 24 36 34 35 2 6 ESSAI DE CARACTERISATION DES GROUPES (ccd>=) avec ces 30 colonnes Groupe 1 : alfalfae effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 1 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 1 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 2 : allii effectif 10 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 2 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 2 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 3 : aurantifoli effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 3 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 3 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 4 : axonopodis effectif 2 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 4 : num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 4 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN Groupe 5 : begoniae effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 5 : num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 5 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 6 : citri effectif 8 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 6 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 6 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 7 : citrumelo effectif 6 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 7 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 7 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 8 : dieffenbach effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 8 : num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 8 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 9 : glycines effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 9 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 9 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 10 : malvacearum effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 10 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 10 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 11 : manihotis effectif 6 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 11 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 11 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 12 : Fuscans effectif 14 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 12 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 12 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 13 : NF1 effectif 8 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 13 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 13 : num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 14 : NF2 effectif 4 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 14 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 14 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 15 : NF3 effectif 4 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 15 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 15 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 16 : ricini effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 16 : num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 16 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 17 : vasculorum effectif 9 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 17 : num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 17 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 Groupe 18 : vesicatoria effectif 7 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 18 : num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 32 ccd = 0.7374 nom = XopC num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 18 : num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 Groupe 19 : vignicola effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 19 : num = 21 ccd = 0.9018 nom = XccB num = 7 ccd = 0.5537 nom = XopQ num = 9 ccd = 0.5495 nom = AvrXacE3 num = 8 ccd = 0.5495 nom = XopE2 num = 36 ccd = 0.2531 nom = AvrXv4 num = 2 ccd = 0.1553 nom = XopN num = 6 ccd = 0.1124 nom = pthA1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 19 : num = 14 ccd = 0.9397 nom = XAC num = 30 ccd = 0.9393 nom = AvrRxo1 num = 22 ccd = 0.9365 nom = AvrXacE2 num = 16 ccd = 0.9172 nom = AvrXacE1 num = 11 ccd = 0.8849 nom = XopP num = 28 ccd = 0.8432 nom = AvrXv3 num = 10 ccd = 0.8161 nom = XopF2 num = 12 ccd = 0.8092 nom = XopE1 num = 23 ccd = 0.7905 nom = XopB num = 33 ccd = 0.7787 nom = AvrBsT num = 15 ccd = 0.6551 nom = HpaF=XAC0393 num = 18 ccd = 0.6178 nom = XccA2 num = 37 ccd = 0.5495 nom = XccC num = 27 ccd = 0.5328 nom = AvrRxv num = 20 ccd = 0.4904 nom = XccE1 num = 13 ccd = 0.3478 nom = ecf num = 31 ccd = 0.3339 nom = XopA num = 25 ccd = 0.3271 nom = XopJ num = 26 ccd = 0.3247 nom = XopO num = 24 ccd = 0.3247 nom = XopD num = 34 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1 num = 35 ccd = 0.2019 nom = AvrBs1.1 COLONNES SPECIFIQUES au sein de ces 30 colonnes la colonne 26 soit XopO caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 18 soit vesicatoria la colonne 24 soit XopD caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 18 soit vesicatoria la colonne 36 soit AvrXv4 caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 19 soit vignicola COLONNES IDENTIQUES au sein de ces 30 colonnes Egale(s) à la colonne 9 soit AvrXacE3 : colonne 8 = XopE2 ; Egale(s) à la colonne 26 soit XopO : colonne 24 = XopD ; Egale(s) à la colonne 34 soit AvrBs1 : colonne 35 = AvrBs1.1 ; COLONNES SEMBLABLES à 95 % au moins Semblable(s) à la colonne 13 soit ecf : colonne 31 à 96.6 % pour XopA ; colonne 25 à 97.5 % pour XopJ ; colonne 26 à 98.3 % pour XopO ; colonne 24 à 98.3 % pour XopD ; colonne 34 à 96.6 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 96.6 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 31 soit XopA : colonne 25 à 97.5 % pour XopJ ; colonne 26 à 98.3 % pour XopO ; colonne 24 à 98.3 % pour XopD ; colonne 34 à 96.6 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 96.6 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 25 soit XopJ : colonne 26 à 99.2 % pour XopO ; colonne 24 à 99.2 % pour XopD ; colonne 34 à 97.5 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 97.5 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 26 soit XopO : colonne 34 à 98.3 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 98.3 % pour AvrBs1.1 ; Semblable(s) à la colonne 24 soit XopD : colonne 34 à 98.3 % pour AvrBs1 ; colonne 35 à 98.3 % pour AvrBs1.1 ; LIGNES EGALES SUR 37 COLONNES (numéro de ligne entre parenthèses) Num Nb Individus 1 2 ( 2) S3836G1 = S7121G1 ( 5) ; 2 8 ( 6) S6107G2 = S6369G2 ( 7) ; S6358G2 ( 8) ; S6359G2 ( 9) ; S6362G2 ( 10) ; S6367G2 ( 12) ; S6376G2 ( 13) ; S6383G2 ( 14) ; 3 2 ( 17) S3529G3 = S2901G3 ( 19) ; 4 2 ( 21) S4924G4 = S5141G4 ( 22) ; 5 2 ( 24) S5677G5 = S1421G5 ( 25) ; 6 2 ( 26) S5676G5 = S5678G5 ( 27) ; 7 3 ( 30) S1209G6 = S5280G6 ( 32) ; S5284G6 ( 33) ; 8 2 ( 34) S2900G6 = S0306G6 ( 35) ; 9 2 ( 36) S3371G7 = S3843G7 ( 40) ; 10 2 ( 37) S3541G7 = S3841G7 ( 38) ; 11 4 ( 42) S3133G8 = S5688G8 ( 44) ; S5693G8 ( 45) ; S5691G8 ( 46) ; 12 3 ( 47) S1519G9 = S2526G9 ( 48) ; S1559G9 ( 51) ; 13 2 ( 49) S7119G9 = S7118G9 ( 50) ; 14 4 ( 52) S2035G10 = S2530G10 ( 53) ; S5701G10 ( 55) ; S5726G10 ( 56) ; 15 6 ( 57) S1860G11 = S2603G11 ( 58) ; S1851G11 ( 59) ; S2624G11 ( 60) ; S6544G11 ( 61) ; S1865G11 ( 62) ; 16 3 ( 64) S4834G12 = S6165G12 ( 65) ; S6167G12 ( 66) ; 17 2 ( 67) S6969G12 = S6965G12 ( 69) ; 18 4 ( 68) S6166G12 = S6975G12 ( 70) ; S6976G12 ( 71) ; S6979G12 ( 72) ; 19 2 ( 74) S6960G12 = S6971G12 ( 76) ; 20 5 ( 77) S2534G13 = S6164G13 ( 78) ; S6987G13 ( 79) ; S6983G13 ( 83) ; S6985G13 ( 84) ; 21 2 ( 80) S6984G13 = S6982G13 ( 81) ; 22 3 ( 85) S6989G14 = S6990G14 ( 86) ; S6991G14 ( 87) ; 23 2 ( 89) S6992G15 = S6993G15 ( 92) ; 24 2 ( 90) S6994G15 = S6996G15 ( 91) ; 25 5 ( 93) S5863G16 = S5864G16 ( 94) ; S5865G16 ( 95) ; S6541G16 ( 96) ; S6542G16 ( 97) ; 26 7 ( 98) S5830G17 = S1215G17 ( 99) ; S5694G17 (100) ; S5695G17 (101) ; S5696G17 (102) ; S5698G17 (103) ; S1289G17 (106) ; 27 2 (104) S5823G17 = S5831G17 (105) ; 28 2 (109) S5618G18 = S6864G18 (112) ; 29 2 (114) S7110G19 = S7112G19 (116) ; 30 3 (115) S7111G19 = S7113G19 (117) ; S7115G19 (118) ; Données initiales au format compressé (IDP) pour Wcabiq/classification ; faire CTRL-A pour tout sélectionner ANALYSE RESTREINTE AUX 30 COLONNES RETENUES Rappel des colonnes utilisées Matrice des fréquences de positivité pour Wcabiq/identification ; faire CTRL-A pour tout sélectionner Test du pouvoir d'identification des 30 colonnes retenues Résultats d'identification au final 118 bien classés sur 118 soit 100.0 % 0 mal classés sur 118 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 64 bien classés sur 118 soit 54.2 % 54 mal classés sur 118 soit 45.8 % Résultats d'identification par groupe Groupe 1 soit alfalfae effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3835G1 1 1 1 100.0 44.4 1 1 1 0 0 0 1 S3836G1 1 1 1 100.0 66.7 2 1 2 0 0 0 2 S3837G1 1 1 1 100.0 66.7 3 1 3 0 0 0 3 S7120G1 1 1 1 100.0 66.7 4 1 4 0 0 0 4 S7121G1 1 1 1 100.0 66.7 5 1 5 0 0 0 5 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 0 bien classés validés sur 5 soit 0.0 % 5 mal classés validés sur 5 soit 100.0 % Groupe 2 soit allii effectif 10 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S6107G2 1 2 2 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S6369G2 1 2 2 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S6358G2 1 2 2 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6359G2 1 2 2 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6362G2 1 2 2 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S6364G2 1 2 2 100.0 1.2 6 1 6 0 0 5 1 S6367G2 1 2 2 100.0 100.0 7 1 7 0 1 6 1 S6376G2 1 2 2 100.0 100.0 8 1 8 0 1 7 1 S6383G2 1 2 2 100.0 100.0 9 1 9 0 1 8 1 S6385G2 1 2 2 100.0 11.1 10 1 10 0 0 8 2 10 bien classés sur 10 soit 100.0 % 0 mal classés sur 10 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 8 bien classés validés sur 10 soit 80.0 % 2 mal classés validés sur 10 soit 20.0 % Groupe 3 soit aurantifoli effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3528G3 1 3 3 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S3529G3 1 3 3 100.0 44.4 2 1 2 0 0 1 1 S3530G3 1 3 3 100.0 66.7 3 1 3 0 0 1 2 S2901G3 1 3 3 100.0 44.4 4 1 4 0 0 1 3 S2866G3 1 3 3 100.0 4.2 5 1 5 0 0 1 4 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 1 bien classés validés sur 5 soit 20.0 % 4 mal classés validés sur 5 soit 80.0 % Groupe 4 soit axonopodis effectif 2 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S4924G4 1 4 4 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S5141G4 1 4 4 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 2 bien classés sur 2 soit 100.0 % 0 mal classés sur 2 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 2 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 2 soit 0.0 % Groupe 5 soit begoniae effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2524G5 1 5 5 100.0 25.0 1 1 1 0 0 0 1 S5677G5 1 5 5 100.0 100.0 2 1 2 0 1 1 1 S1421G5 1 5 5 100.0 100.0 3 1 3 0 1 2 1 S5676G5 1 5 5 100.0 66.7 4 1 4 0 0 2 2 S5678G5 1 5 5 100.0 66.7 5 1 5 0 0 2 3 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 5 soit 40.0 % 3 mal classés validés sur 5 soit 60.0 % Groupe 6 soit citri effectif 8 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2525G6 1 6 6 100.0 4.8 1 1 1 0 0 0 1 S3369G6 1 6 6 100.0 11.1 2 1 2 0 0 0 2 S1209G6 1 6 6 100.0 100.0 3 1 3 0 1 1 2 S1814G6 1 6 6 100.0 33.3 4 1 4 0 0 1 3 S5280G6 1 6 6 100.0 100.0 5 1 5 0 1 2 3 S5284G6 1 6 6 100.0 100.0 6 1 6 0 1 3 3 S2900G6 1 6 6 100.0 33.3 7 1 7 0 0 3 4 S0306G6 1 6 6 100.0 33.3 8 1 8 0 0 3 5 8 bien classés sur 8 soit 100.0 % 0 mal classés sur 8 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés validés sur 8 soit 37.5 % 5 mal classés validés sur 8 soit 62.5 % Groupe 7 soit citrumelo effectif 6 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3371G7 1 7 7 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S3541G7 1 7 7 100.0 50.0 2 1 2 0 0 1 1 S3841G7 1 7 7 100.0 50.0 3 1 3 0 0 1 2 S3842G7 1 7 7 100.0 50.0 4 1 4 0 0 1 3 S3843G7 1 7 7 100.0 100.0 5 1 5 0 1 2 3 S3114G7 1 7 7 100.0 10.0 6 1 6 0 0 2 4 6 bien classés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés sur 6 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 6 soit 33.3 % 4 mal classés validés sur 6 soit 66.7 % Groupe 8 soit dieffenbach effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3133G8 1 8 8 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S3132G8 1 8 8 100.0 25.0 2 1 2 0 0 1 1 S5688G8 1 8 8 100.0 100.0 3 1 3 0 1 2 1 S5693G8 1 8 8 100.0 100.0 4 1 4 0 1 3 1 S5691G8 1 8 8 100.0 100.0 5 1 5 0 1 4 1 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 5 soit 80.0 % 1 mal classés validés sur 5 soit 20.0 % Groupe 9 soit glycines effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1519G9 1 9 9 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2526G9 1 9 9 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S7119G9 1 9 9 100.0 66.7 3 1 3 0 0 2 1 S7118G9 1 9 9 100.0 66.7 4 1 4 0 0 2 2 S1559G9 1 9 9 100.0 100.0 5 1 5 0 1 3 2 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés validés sur 5 soit 60.0 % 2 mal classés validés sur 5 soit 40.0 % Groupe 10 soit malvacearum effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2035G10 1 10 10 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2530G10 1 10 10 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S5700G10 1 10 10 100.0 25.0 3 1 3 0 0 2 1 S5701G10 1 10 10 100.0 100.0 4 1 4 0 1 3 1 S5726G10 1 10 10 100.0 100.0 5 1 5 0 1 4 1 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 5 soit 80.0 % 1 mal classés validés sur 5 soit 20.0 % Groupe 11 soit manihotis effectif 6 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1860G11 1 11 11 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S2603G11 1 11 11 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S1851G11 1 11 11 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S2624G11 1 11 11 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6544G11 1 11 11 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S1865G11 1 11 11 100.0 100.0 6 1 6 0 1 6 0 6 bien classés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés sur 6 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 6 bien classés validés sur 6 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 6 soit 0.0 % Groupe 12 soit Fuscans effectif 14 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1815G12 1 12 12 100.0 10.9 1 1 1 0 0 0 1 S4834G12 1 12 12 100.0 30.0 2 1 2 0 0 0 2 S6165G12 1 12 12 100.0 30.0 3 1 3 0 0 0 3 S6167G12 1 12 12 100.0 30.0 4 1 4 0 0 0 4 S6969G12 1 12 12 100.0 100.0 5 1 5 0 1 1 4 S6166G12 1 12 12 100.0 40.0 6 1 6 0 0 1 5 S6965G12 1 12 12 100.0 100.0 7 1 7 0 1 2 5 S6975G12 1 12 12 100.0 40.0 8 1 8 0 0 2 6 S6976G12 1 12 12 100.0 40.0 9 1 9 0 0 2 7 S6979G12 1 12 12 100.0 40.0 10 1 10 0 0 2 8 S1845G12 1 12 12 100.0 27.3 11 1 11 0 0 2 9 S6960G12 1 12 12 100.0 75.0 12 1 12 0 0 2 10 S6970G12 1 12 12 100.0 20.5 13 1 13 0 0 2 11 S6971G12 1 12 12 100.0 75.0 14 1 14 0 0 2 12 14 bien classés sur 14 soit 100.0 % 0 mal classés sur 14 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 2 bien classés validés sur 14 soit 14.3 % 12 mal classés validés sur 14 soit 85.7 % Groupe 13 soit NF1 effectif 8 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S2534G13 1 13 13 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S6164G13 1 13 13 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S6987G13 1 13 13 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6984G13 1 13 13 100.0 60.0 4 1 4 0 0 3 1 S6982G13 1 13 13 100.0 60.0 5 1 5 0 0 3 2 S0412G13 1 13 13 100.0 1.2 6 1 6 0 0 3 3 S6983G13 1 13 13 100.0 100.0 7 1 7 0 1 4 3 S6985G13 1 13 13 100.0 100.0 8 1 8 0 1 5 3 8 bien classés sur 8 soit 100.0 % 0 mal classés sur 8 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 5 bien classés validés sur 8 soit 62.5 % 3 mal classés validés sur 8 soit 37.5 % Groupe 14 soit NF2 effectif 4 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S6989G14 1 14 14 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S6990G14 1 14 14 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S6991G14 1 14 14 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6988G14 1 14 14 100.0 33.3 4 1 4 0 0 3 1 4 bien classés sur 4 soit 100.0 % 0 mal classés sur 4 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés validés sur 4 soit 75.0 % 1 mal classés validés sur 4 soit 25.0 % Groupe 15 soit NF3 effectif 4 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S6992G15 1 15 15 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S6994G15 1 15 15 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S6996G15 1 15 15 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6993G15 1 15 15 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 4 bien classés sur 4 soit 100.0 % 0 mal classés sur 4 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 4 bien classés validés sur 4 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 4 soit 0.0 % Groupe 16 soit ricini effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S5863G16 1 16 16 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S5864G16 1 16 16 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S5865G16 1 16 16 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6541G16 1 16 16 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6542G16 1 16 16 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 5 bien classés validés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés validés sur 5 soit 0.0 % Groupe 17 soit vasculorum effectif 9 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S5830G17 1 17 17 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S1215G17 1 17 17 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S5694G17 1 17 17 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S5695G17 1 17 17 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S5696G17 1 17 17 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S5698G17 1 17 17 100.0 100.0 6 1 6 0 1 6 0 S5823G17 1 17 17 100.0 28.6 7 1 7 0 0 6 1 S5831G17 1 17 17 100.0 28.6 8 1 8 0 0 6 2 S1289G17 1 17 17 100.0 100.0 9 1 9 0 1 7 2 9 bien classés sur 9 soit 100.0 % 0 mal classés sur 9 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 7 bien classés validés sur 9 soit 77.8 % 2 mal classés validés sur 9 soit 22.2 % Groupe 18 soit vesicatoria effectif 7 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1604G18 1 18 18 100.0 75.0 1 1 1 0 0 0 1 S5594G18 1 18 18 100.0 16.0 2 1 2 0 0 0 2 S5618G18 1 18 18 100.0 42.2 3 1 3 0 0 0 3 S0000G18 1 18 18 100.0 16.7 4 1 4 0 0 0 4 S2484G18 1 18 18 100.0 56.2 5 1 5 0 0 0 5 S6864G18 1 18 18 100.0 42.2 6 1 6 0 0 0 6 S6817G18 1 18 18 100.0 2.7 7 1 7 0 0 0 7 7 bien classés sur 7 soit 100.0 % 0 mal classés sur 7 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 0 bien classés validés sur 7 soit 0.0 % 7 mal classés validés sur 7 soit 100.0 % Groupe 19 soit vignicola effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S7110G19 1 19 19 100.0 66.7 1 1 1 0 0 0 1 S7111G19 1 19 19 100.0 100.0 2 1 2 0 1 1 1 S7112G19 1 19 19 100.0 66.7 3 1 3 0 0 1 2 S7113G19 1 19 19 100.0 100.0 4 1 4 0 1 2 2 S7115G19 1 19 19 100.0 100.0 5 1 5 0 1 3 2 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 3 bien classés sur 5 soit 60.0 % 2 mal classés sur 5 soit 40.0 % Résumé des identifications par groupe Numéro Groupe Effectif % BC % BCV 1 alfalfae 5 100 0 2 allii 10 100 80 3 aurantifoli 5 100 20 4 axonopodis 2 100 100 5 begoniae 5 100 40 6 citri 8 100 37 7 citrumelo 6 100 33 8 dieffenbach 5 100 80 9 glycines 5 100 60 10 malvacearum 5 100 80 11 manihotis 6 100 100 12 Fuscans 14 100 14 13 NF1 8 100 62 14 NF2 4 100 75 15 NF3 4 100 100 16 ricini 5 100 100 17 vasculorum 9 100 77 18 vesicatoria 7 100 0 19 vignicola 5 100 60 -- fin des calculs, version 1.51
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