Calculs de CCD (cli) version 1.01 pour flagrant
Groupes Colonnes Lignes (données binaires avec indication de groupe) On travaille donc avec 27 individus, 39 colonnes et 4 groupes. Codes couleurs utilisés pour les pourcentages
0 % <= pct < 10 % jaune 10 % <= pct <= 90 % orange 90 % < pct <= 100 % rouge Description des groupes Num Nom Effectif Pourcentage Individus 1 ALF 5 18.5 % S3835G1 S3836G1 S3837G1 S7120G1 S7121G1 2 ALI 10 37.0 % S6107G2 S6369G2 S6358G2 S6359G2 S6362G2 S6364G2 S6367G2 S6376G2 S6383G2 S6385G2 3 VESI 7 25.9 % S1604g3 S5594g3 S5618g3 S0000g3 S2484g3 S6864g3 S6817g3 4 VIGNI 5 18.5 % S7110g4 S7111g4 S7112g4 S7113g4 S7115g4
Description globale des colonnes Numéro Colonne Nb_0 Pct_0 | Nb_1 Pct_1 1 YzuF1 0 0 % | 27 100 % 2 YzuN 0 0 % | 27 100 % 3 YzuY 0 0 % | 27 100 % 4 HuaYac 0 0 % | 27 100 % 5 BvrBs2 0 0 % | 27 100 % 6 uthB1 3 11 % | 24 89 % 7 YzuQ 10 37 % | 17 63 % 8 YzuE2 0 0 % | 27 100 % 9 BvrYacE3 0 0 % | 27 100 % 10 YzuF2 5 19 % | 22 81 % 11 YzuP 5 19 % | 22 81 % 12 YzuE1 11 41 % | 16 59 % 13 ecf 18 67 % | 9 33 % 14 YBC_ 24 89 % | 3 11 % 15 HuaF 24 89 % | 3 11 % 16 BvrYacE1 11 41 % | 16 59 % 17 YccB1 27 100 % | 0 0 % 18 YccB2 22 81 % | 5 19 % 19 HuaBYcc 27 100 % | 0 0 % 20 YccE1 21 78 % | 6 22 % 21 YccB 17 63 % | 10 37 % 22 BvrYacE2 22 81 % | 5 19 % 23 YzuB 20 74 % | 7 26 % 24 YzuD 20 74 % | 7 26 % 25 YzuJ 20 74 % | 7 26 % 26 YzuO 20 74 % | 7 26 % 27 BvrRxv 11 41 % | 16 59 % 28 BvrYv3 12 44 % | 15 56 % 29 YCC2565 27 100 % | 0 0 % 30 BvrRxz1 5 19 % | 22 81 % 31 YzuB 20 74 % | 7 26 % 32 YzuC 15 56 % | 12 44 % 33 BvrBsT 24 89 % | 3 11 % 34 BvrBs1 22 81 % | 5 19 % 35 BvrBs1.1 22 81 % | 5 19 % 36 BvrYv4 22 81 % | 5 19 % 37 YccC 17 63 % | 10 37 % 38 GH1 13 48 % | 14 52 % 39 GH2 15 56 % | 12 44 % Positivité des colonnes
100 % 100 % 100 % 100 % 100 % 89 % 63 % 100 % 100 % 81 % 81 % 59 % 33 % 11 % 11 % 59 % 0 % 19 % 0 % 22 % 37 % 19 % 26 % 26 % 26 % 26 % 59 % 56 % 0 % 81 % 26 % 44 % 11 % 19 % 19 % 19 % 37 % 52 % 44 % 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 YzuF1 YzuN YzuY HuaYa BvrBs uthB1 YzuQ YzuE2 BvrYa YzuF2 YzuP YzuE1 ecf YBC_ HuaF BvrYa YccB1 YccB2 HuaBY YccE1 YccB BvrYa YzuB YzuD YzuJ YzuO BvrRx BvrYv YCC25 BvrRx YzuB YzuC BvrBs BvrBs BvrBs BvrYv YccC GH1 GH2 VALEUR DES CCD Colonne CCD Nom (NS=non significatif) 1 NS YzuF1 2 NS YzuN 3 NS YzuY 4 NS HuaYac 5 NS BvrBs2 6 0.247829 uthB1 7 0.950956 YzuQ 8 NS YzuE2 9 NS BvrYacE3 10 0.691290 YzuF2 11 0.691290 YzuP 12 0.801417 YzuE1 13 0.738490 ecf 14 0.247829 YBC_ 15 0.247829 HuaF 16 0.801417 BvrYacE1 17 NS YccB1 18 0.691290 YccB2 19 NS HuaBYcc 20 0.610808 YccE1 21 0.950956 YccB 22 0.691290 BvrYacE2 23 0.825627 YzuB 24 0.825627 YzuD 25 0.825627 YzuJ 26 0.825627 YzuO 27 0.801417 BvrRxv 28 0.991076 BvrYv3 29 NS YCC2565 30 0.691290 BvrRxz1 31 0.825627 YzuB 32 0.631465 YzuC 33 0.170056 BvrBsT 34 0.467518 BvrBs1 35 0.467518 BvrBs1.1 36 0.691290 BvrYv4 37 0.950956 YccC 38 0.013599 GH1 39 0.991076 GH2 Rangement par ordre d'importance des CCD CCD Numéro Nom 0.9911 28 BvrYv3 0.9911 39 GH2 0.9510 7 YzuQ 0.9510 37 YccC 0.9510 21 YccB 0.8256 26 YzuO 0.8256 23 YzuB 0.8256 31 YzuB 0.8256 24 YzuD 0.8256 25 YzuJ 0.8014 12 YzuE1 0.8014 27 BvrRxv 0.8014 16 BvrYacE1 0.7385 13 ecf 0.6913 22 BvrYacE2 0.6913 18 YccB2 0.6913 10 YzuF2 0.6913 36 BvrYv4 0.6913 11 YzuP 0.6913 30 BvrRxz1 0.6315 32 YzuC 0.6108 20 YccE1 0.4675 35 BvrBs1.1 0.4675 34 BvrBs1 0.2478 14 YBC_ 0.2478 15 HuaF 0.2478 6 uthB1 0.1701 33 BvrBsT 0.0136 38 GH1 pour les autres colonnes, le ccd vaut 0, ou moins de 0.0001 Seuil utilisé : (choix utilisateur) Liste des 29 colonnes retenues via ce seuil CCD Numéro Nom 0.9911 28 BvrYv3 0.9911 39 GH2 0.9510 7 YzuQ 0.9510 37 YccC 0.9510 21 YccB 0.8256 26 YzuO 0.8256 23 YzuB 0.8256 31 YzuB 0.8256 24 YzuD 0.8256 25 YzuJ 0.8014 12 YzuE1 0.8014 27 BvrRxv 0.8014 16 BvrYacE1 0.7385 13 ecf 0.6913 22 BvrYacE2 0.6913 18 YccB2 0.6913 10 YzuF2 0.6913 36 BvrYv4 0.6913 11 YzuP 0.6913 30 BvrRxz1 0.6315 32 YzuC 0.6108 20 YccE1 0.4675 35 BvrBs1.1 0.4675 34 BvrBs1 0.2478 14 YBC_ 0.2478 15 HuaF 0.2478 6 uthB1 0.1701 33 BvrBsT 0.0136 38 GH1 Positivité de ces 29 colonnes par groupe en % : (laissez la souris sur les numéros de groupe et de colonne pour en avoir le nom) . Colonnes Groupe . 28 39 7 37 21 26 23 31 24 25 12 27 16 13 22 18 10 36 11 30 32 20 35 34 14 15 6 33 38 1 . 100 100 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 40 100 100 100 0 100 100 40 0 0 0 0 0 100 40 60 2 . 100 0 0 100 0 0 0 0 0 0 90 90 90 0 0 0 100 0 100 100 0 0 0 0 0 0 100 0 50 3 . 0 100 100 0 0 100 100 100 100 100 100 100 100 100 0 0 100 0 100 100 100 85 71 71 42 42 57 14 42 4 . 0 0 100 0 100 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 100 0 0 60 0 0 0 0 0 100 0 60 tous . 55 44 62 37 37 25 25 25 25 25 59 59 59 33 18 18 81 18 81 81 44 22 18 18 11 11 88 11 51 Groupe . 28 39 7 37 21 26 23 31 24 25 12 27 16 13 22 18 10 36 11 30 32 20 35 34 14 15 6 33 38 Visualisation de la positivité de ces 29 colonnes par groupe :
Colonnes Groupe . 28 39 7 37 21 26 23 31 24 25 12 27 16 13 22 18 10 36 11 30 32 20 35 34 14 15 6 33 38 1 2 3 4 tous . Groupe . 28 39 7 37 21 26 23 31 24 25 12 27 16 13 22 18 10 36 11 30 32 20 35 34 14 15 6 33 38 ESSAI DE CARACTERISATION DES GROUPES (ccd>=) avec ces 29 colonnes Groupe 1 : ALF effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 1 : num = 28 ccd = 0.9911 nom = BvrYv3 num = 39 ccd = 0.9911 nom = GH2 num = 7 ccd = 0.9510 nom = YzuQ num = 21 ccd = 0.9510 nom = YccB num = 22 ccd = 0.6913 nom = BvrYacE2 num = 18 ccd = 0.6913 nom = YccB2 num = 10 ccd = 0.6913 nom = YzuF2 num = 11 ccd = 0.6913 nom = YzuP num = 30 ccd = 0.6913 nom = BvrRxz1 num = 6 ccd = 0.2478 nom = uthB1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 1 : num = 37 ccd = 0.9510 nom = YccC num = 26 ccd = 0.8256 nom = YzuO num = 23 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 31 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 24 ccd = 0.8256 nom = YzuD num = 25 ccd = 0.8256 nom = YzuJ num = 12 ccd = 0.8014 nom = YzuE1 num = 27 ccd = 0.8014 nom = BvrRxv num = 16 ccd = 0.8014 nom = BvrYacE1 num = 36 ccd = 0.6913 nom = BvrYv4 num = 20 ccd = 0.6108 nom = YccE1 num = 35 ccd = 0.4675 nom = BvrBs1.1 num = 34 ccd = 0.4675 nom = BvrBs1 num = 14 ccd = 0.2478 nom = YBC_ num = 15 ccd = 0.2478 nom = HuaF Groupe 2 : ALI effectif 10 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 2 : num = 28 ccd = 0.9911 nom = BvrYv3 num = 37 ccd = 0.9510 nom = YccC num = 10 ccd = 0.6913 nom = YzuF2 num = 11 ccd = 0.6913 nom = YzuP num = 30 ccd = 0.6913 nom = BvrRxz1 num = 6 ccd = 0.2478 nom = uthB1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 2 : num = 39 ccd = 0.9911 nom = GH2 num = 7 ccd = 0.9510 nom = YzuQ num = 21 ccd = 0.9510 nom = YccB num = 26 ccd = 0.8256 nom = YzuO num = 23 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 31 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 24 ccd = 0.8256 nom = YzuD num = 25 ccd = 0.8256 nom = YzuJ num = 13 ccd = 0.7385 nom = ecf num = 22 ccd = 0.6913 nom = BvrYacE2 num = 18 ccd = 0.6913 nom = YccB2 num = 36 ccd = 0.6913 nom = BvrYv4 num = 32 ccd = 0.6315 nom = YzuC num = 20 ccd = 0.6108 nom = YccE1 num = 35 ccd = 0.4675 nom = BvrBs1.1 num = 34 ccd = 0.4675 nom = BvrBs1 num = 14 ccd = 0.2478 nom = YBC_ num = 15 ccd = 0.2478 nom = HuaF num = 33 ccd = 0.1701 nom = BvrBsT Groupe 3 : VESI effectif 7 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 3 : num = 39 ccd = 0.9911 nom = GH2 num = 7 ccd = 0.9510 nom = YzuQ num = 26 ccd = 0.8256 nom = YzuO num = 23 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 31 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 24 ccd = 0.8256 nom = YzuD num = 25 ccd = 0.8256 nom = YzuJ num = 12 ccd = 0.8014 nom = YzuE1 num = 27 ccd = 0.8014 nom = BvrRxv num = 16 ccd = 0.8014 nom = BvrYacE1 num = 13 ccd = 0.7385 nom = ecf num = 10 ccd = 0.6913 nom = YzuF2 num = 11 ccd = 0.6913 nom = YzuP num = 30 ccd = 0.6913 nom = BvrRxz1 num = 32 ccd = 0.6315 nom = YzuC colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 3 : num = 28 ccd = 0.9911 nom = BvrYv3 num = 37 ccd = 0.9510 nom = YccC num = 21 ccd = 0.9510 nom = YccB num = 22 ccd = 0.6913 nom = BvrYacE2 num = 18 ccd = 0.6913 nom = YccB2 num = 36 ccd = 0.6913 nom = BvrYv4 Groupe 4 : VIGNI effectif 5 colonne(s) de valeur 1 caractérisant le groupe 4 : num = 7 ccd = 0.9510 nom = YzuQ num = 21 ccd = 0.9510 nom = YccB num = 36 ccd = 0.6913 nom = BvrYv4 num = 6 ccd = 0.2478 nom = uthB1 colonne(s) de valeur 0 caractérisant le groupe 4 : num = 28 ccd = 0.9911 nom = BvrYv3 num = 39 ccd = 0.9911 nom = GH2 num = 37 ccd = 0.9510 nom = YccC num = 26 ccd = 0.8256 nom = YzuO num = 23 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 31 ccd = 0.8256 nom = YzuB num = 24 ccd = 0.8256 nom = YzuD num = 25 ccd = 0.8256 nom = YzuJ num = 12 ccd = 0.8014 nom = YzuE1 num = 27 ccd = 0.8014 nom = BvrRxv num = 16 ccd = 0.8014 nom = BvrYacE1 num = 13 ccd = 0.7385 nom = ecf num = 22 ccd = 0.6913 nom = BvrYacE2 num = 18 ccd = 0.6913 nom = YccB2 num = 10 ccd = 0.6913 nom = YzuF2 num = 11 ccd = 0.6913 nom = YzuP num = 30 ccd = 0.6913 nom = BvrRxz1 num = 20 ccd = 0.6108 nom = YccE1 num = 35 ccd = 0.4675 nom = BvrBs1.1 num = 34 ccd = 0.4675 nom = BvrBs1 num = 14 ccd = 0.2478 nom = YBC_ num = 15 ccd = 0.2478 nom = HuaF num = 33 ccd = 0.1701 nom = BvrBsT COLONNES SPECIFIQUES au sein de ces 29 colonnes la colonne 7 soit YzuQ caractérise à elle seule via la modalité 0 le groupe 2 soit ALI la colonne 37 soit YccC caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 2 soit ALI la colonne 26 soit YzuO caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 3 soit VESI la colonne 23 soit YzuB caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 3 soit VESI la colonne 31 soit YzuB caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 3 soit VESI la colonne 24 soit YzuD caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 3 soit VESI la colonne 25 soit YzuJ caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 3 soit VESI la colonne 22 soit BvrYacE2 caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 1 soit ALF la colonne 18 soit YccB2 caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 1 soit ALF la colonne 10 soit YzuF2 caractérise à elle seule via la modalité 0 le groupe 4 soit VIGNI la colonne 36 soit BvrYv4 caractérise à elle seule via la modalité 1 le groupe 4 soit VIGNI la colonne 11 soit YzuP caractérise à elle seule via la modalité 0 le groupe 4 soit VIGNI la colonne 30 soit BvrRxz1 caractérise à elle seule via la modalité 0 le groupe 4 soit VIGNI COLONNES IDENTIQUES au sein de ces 29 colonnes Egale(s) à la colonne 26 soit YzuO : colonne 23 = YzuB ; colonne 31 = YzuB ; colonne 24 = YzuD ; colonne 25 = YzuJ ; Egale(s) à la colonne 23 soit YzuB : colonne 31 = YzuB ; colonne 24 = YzuD ; colonne 25 = YzuJ ; Egale(s) à la colonne 31 soit YzuB : colonne 24 = YzuD ; colonne 25 = YzuJ ; Egale(s) à la colonne 24 soit YzuD : colonne 25 = YzuJ ; Egale(s) à la colonne 12 soit YzuE1 : colonne 16 = BvrYacE1 ; Egale(s) à la colonne 22 soit BvrYacE2 : colonne 18 = YccB2 ; Egale(s) à la colonne 10 soit YzuF2 : colonne 11 = YzuP ; colonne 30 = BvrRxz1 ; Egale(s) à la colonne 11 soit YzuP : colonne 30 = BvrRxz1 ; Egale(s) à la colonne 35 soit BvrBs1.1 : colonne 34 = BvrBs1 ; Egale(s) à la colonne 14 soit YBC_ : colonne 15 = HuaF ; COLONNES SEMBLABLES à 95 % au moins Semblable(s) à la colonne 26 soit YzuO : colonne 20 à 96.3 % pour YccE1 ; Semblable(s) à la colonne 23 soit YzuB : colonne 20 à 96.3 % pour YccE1 ; Semblable(s) à la colonne 31 soit YzuB : colonne 20 à 96.3 % pour YccE1 ; Semblable(s) à la colonne 24 soit YzuD : colonne 20 à 96.3 % pour YccE1 ; Semblable(s) à la colonne 25 soit YzuJ : colonne 20 à 96.3 % pour YccE1 ; Semblable(s) à la colonne 20 soit YccE1 : colonne 35 à 96.3 % pour BvrBs1.1 ; colonne 34 à 96.3 % pour BvrBs1 ; LIGNES EGALES SUR 39 COLONNES (numéro de ligne entre parenthèses) Num Nb Individus 1 5 ( 6) S6107G2 = S6358G2 ( 8) ; S6362G2 ( 10) ; S6367G2 ( 12) ; S6383G2 ( 14) ; 2 3 ( 7) S6369G2 = S6359G2 ( 9) ; S6376G2 ( 13) ; 3 2 ( 23) S7110g4 = S7112g4 ( 25) ; 4 2 ( 24) S7111g4 = S7113g4 ( 26) ; Données initiales au format compressé (IDP) pour Wcabiq/classification ; faire CTRL-A pour tout sélectionner ANALYSE RESTREINTE AUX 29 COLONNES RETENUES Rappel des colonnes utilisées Matrice des fréquences de positivité pour Wcabiq/identification ; faire CTRL-A pour tout sélectionner Test du pouvoir d'identification des 29 colonnes retenues Résultats d'identification au final 27 bien classés sur 27 soit 100.0 % 0 mal classés sur 27 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 9 bien classés sur 27 soit 33.3 % 18 mal classés sur 27 soit 66.7 % Résultats d'identification par groupe Groupe 1 soit ALF effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S3835G1 1 1 1 100.0 44.4 1 1 1 0 0 0 1 S3836G1 1 1 1 100.0 44.4 2 1 2 0 0 0 2 S3837G1 1 1 1 100.0 66.7 3 1 3 0 0 0 3 S7120G1 1 1 1 100.0 44.4 4 1 4 0 0 0 4 S7121G1 1 1 1 100.0 66.7 5 1 5 0 0 0 5 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 0 bien classés validés sur 5 soit 0.0 % 5 mal classés validés sur 5 soit 100.0 % Groupe 2 soit ALI effectif 10 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S6107G2 1 2 2 100.0 100.0 1 1 1 0 1 1 0 S6369G2 1 2 2 100.0 100.0 2 1 2 0 1 2 0 S6358G2 1 2 2 100.0 100.0 3 1 3 0 1 3 0 S6359G2 1 2 2 100.0 100.0 4 1 4 0 1 4 0 S6362G2 1 2 2 100.0 100.0 5 1 5 0 1 5 0 S6364G2 1 2 2 100.0 1.2 6 1 6 0 0 5 1 S6367G2 1 2 2 100.0 100.0 7 1 7 0 1 6 1 S6376G2 1 2 2 100.0 100.0 8 1 8 0 1 7 1 S6383G2 1 2 2 100.0 100.0 9 1 9 0 1 8 1 S6385G2 1 2 2 100.0 11.1 10 1 10 0 0 8 2 10 bien classés sur 10 soit 100.0 % 0 mal classés sur 10 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 8 bien classés validés sur 10 soit 80.0 % 2 mal classés validés sur 10 soit 20.0 % Groupe 3 soit VESI effectif 7 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S1604g3 1 3 3 100.0 75.0 1 1 1 0 0 0 1 S5594g3 1 3 3 100.0 12.0 2 1 2 0 0 0 2 S5618g3 1 3 3 100.0 42.2 3 1 3 0 0 0 3 S0000g3 1 3 3 100.0 12.5 4 1 4 0 0 0 4 S2484g3 1 3 3 100.0 56.2 5 1 5 0 0 0 5 S6864g3 1 3 3 100.0 31.6 6 1 6 0 0 0 6 S6817g3 1 3 3 100.0 2.7 7 1 7 0 0 0 7 7 bien classés sur 7 soit 100.0 % 0 mal classés sur 7 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 0 bien classés validés sur 7 soit 0.0 % 7 mal classés validés sur 7 soit 100.0 % Groupe 4 soit VIGNI effectif 5 NomInd Deci Org Fin Seuil Valid NDE BC NBC NMC BCV NBCV NMCV S7110g4 1 4 4 100.0 66.7 1 1 1 0 0 0 1 S7111g4 1 4 4 100.0 66.7 2 1 2 0 0 0 2 S7112g4 1 4 4 100.0 66.7 3 1 3 0 0 0 3 S7113g4 1 4 4 100.0 66.7 4 1 4 0 0 0 4 S7115g4 1 4 4 100.0 100.0 5 1 5 0 1 1 4 5 bien classés sur 5 soit 100.0 % 0 mal classés sur 5 soit 0.0 % avec un seuil de validation de 90 % : 1 bien classés sur 5 soit 20.0 % 4 mal classés sur 5 soit 80.0 % Résumé des identifications par groupe Numéro Groupe Effectif % BC % BCV 1 ALF 5 100 0 2 ALI 10 100 80 3 VESI 7 100 0 4 VIGNI 5 100 20 -- fin des calculs, version 1.51
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